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        使用網(wǎng)絡(luò)來(lái)了解組織特異性基因調(diào)控
        
			
        
				2018-12-19 10:48:15
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			  來(lái)源：
			
        
		
        
				
		
        
			
        布里格姆婦女醫(yī)院的研究人員已經(jīng)發(fā)現(xiàn)，不同的組織功能來(lái)自核心生物機(jī)制，這些機(jī)器主要由組織共享，而不是來(lái)自他們自己的個(gè)體監(jiān)管機(jī)構(gòu)。在Cell Reports上發(fā)表的一篇論文中網(wǎng)絡(luò)醫(yī)學(xué)Channing部門的Kimberly Glass博士和她的團(tuán)隊(duì)解釋了他們?nèi)绾问褂肞ANDA(在網(wǎng)絡(luò)之間傳遞數(shù)據(jù)同化的屬性)來(lái)創(chuàng)建轉(zhuǎn)錄因子和基因之間相互作用的網(wǎng)絡(luò)模型，發(fā)現(xiàn)存在不同的組織功能是監(jiān)管網(wǎng)絡(luò)中細(xì)微的，組織特異性變化的結(jié)果。對(duì)于這些組織特定功能中的每一個(gè)，網(wǎng)絡(luò)具有相同的核心組件，但它們以不同的方式與增加的遺傳和環(huán)境信息組合。該團(tuán)隊(duì)分析了來(lái)自基因型 - 組織表達(dá)(GTEx)聯(lián)盟以及其他監(jiān)管信息來(lái)源的數(shù)據(jù)，以重建和表征38種組織的調(diào)節(jié)網(wǎng)絡(luò)。
        

        使用網(wǎng)絡(luò)來(lái)了解組織特異性基因調(diào)控
        

        PANDA是Glass和她的團(tuán)隊(duì)在2013年創(chuàng)建的模型，因此可以更準(zhǔn)確地模擬轉(zhuǎn)錄因子之間的相互作用 - 這有助于控制基因被激活的位置，時(shí)間和程度- 以及它們的目標(biāo)?？偨Y(jié)轉(zhuǎn)錄因子和基因之間的復(fù)雜相互作用是理解網(wǎng)絡(luò)中模式的重要一步，這些模式告知基因調(diào)控如何產(chǎn)生各種特定的組織功能。
        

        作者還觀察到特定組織功能的調(diào)節(jié)很大程度上不依賴于轉(zhuǎn)錄因子的表達(dá)。他們指出，人類基因組中大約有30,000個(gè)基因，但其中只有不到2,000個(gè)編碼轉(zhuǎn)錄因子。“必須進(jìn)行大量的過(guò)程才能使組織正常運(yùn)作，”格拉斯說(shuō)。“ 我們發(fā)現(xiàn)將這些調(diào)節(jié)因子連接到其靶基因的網(wǎng)絡(luò)被重新配置以更有效地協(xié)調(diào)這些組織功能的激活，而不是激活特定的轉(zhuǎn)錄因子來(lái)實(shí)現(xiàn)這些不同的過(guò)程。”
        

        該團(tuán)隊(duì)指出，他們的工作突出了在開發(fā)藥物治療時(shí)考慮特定組織背景的重要性。鑒于轉(zhuǎn)移的監(jiān)管網(wǎng)絡(luò)管理不同的功能，這對(duì)于理解藥物在靶組織外的潛在副作用將是重要的。
        
			

			
          
        
			
        
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