病毒偵探 褐鱒死亡的秘密被發(fā)現(xiàn)
每年夏天在德國南部,奧地利和瑞士,大量的褐鱒魚都會(huì)滅亡。來自慕尼黑工業(yè)大學(xué)(TUM)的一個(gè)跨學(xué)科團(tuán)隊(duì)現(xiàn)在發(fā)現(xiàn)了神秘的垂死鱒魚的罪魁禍?zhǔn)?。它是由一種以前未知的病毒引發(fā)的,該病毒與感染北大西洋和太平洋鮭魚的病毒有關(guān)。
設(shè)置始終位于相同的河段。受害者總是褐鱒魚。在幾天內(nèi),他們的皮膚變黑,動(dòng)物就會(huì)死亡。幾十年來,研究人員和當(dāng)局一直在尋找造成這種神秘大規(guī)模死亡的原因 - 迄今為止沒有成功。
利用尖端分析方法,來自慕尼黑工業(yè)大學(xué)的RalphKühn教授和研究小組現(xiàn)已確定了引發(fā)褐鱒增生性變黑綜合癥(PDS)的病原體。
從河流到實(shí)驗(yàn)室
“最大的挑戰(zhàn)是找出一個(gè)沒人知道的病原體。一開始,它甚至不清楚是細(xì)菌,病毒,寄生蟲還是環(huán)境毒素,”生物學(xué)家回憶道。
隨后進(jìn)行了十年的科學(xué)偵探工作。研究人員建立了兩個(gè)實(shí)驗(yàn)站的Iller河畔河流之一的源頭,奧伯斯多夫,其中近魚從未被觀察到的疾病; 在肯普滕附近的低層中的第二個(gè),每年夏天都會(huì)有棕色鱒魚死亡。
在兩個(gè)站點(diǎn),研究人員建立了用河水喂養(yǎng)的水族館。從5月到9月,他們觀察了水族箱中的魚,并取出了冷凍的組織樣本,并送到TUM實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行分析。
尋找下一代技術(shù)的線索
觀察結(jié)果表明,PDS分三個(gè)階段進(jìn)展。最初,魚看起來很健康。然后出現(xiàn)肝臟和腎臟等內(nèi)臟器官的變化。在第三階段,褐鱒皮膚變黑,此后不久動(dòng)物死亡。“這種疾病的進(jìn)展很快導(dǎo)致我們懷疑PDS是一種病毒性疾病,”Kühn說。
為了檢測樣本中的病毒,研究人員部署了一套現(xiàn)代分子遺傳程序,稱為下一代技術(shù)??梢允褂眠@些程序嚴(yán)格分析基因組。
首先,在基因反應(yīng)水平上表征魚中疾病的進(jìn)展。隨后,研究人員研究了具有相似免疫反應(yīng)的動(dòng)物,以確定魚的所有遺傳物質(zhì)的核苷酸序列及其可能的病原體。
在遺傳干草堆的針
研究人員部署了計(jì)算機(jī)程序,以確定這一基因數(shù)據(jù)中的致病病毒。利用深層生物信息學(xué)處理,他們成功地鑒定了病原體遺傳譜的部分,并將其與已知病毒的譜進(jìn)行了比較。
擴(kuò)展的病毒特異性測序?qū)е虏《净蚪M的確定。結(jié)果:褐鱒魚死亡背后的罪魁禍?zhǔn)资囚~類呼腸孤病毒。它與感染北大西洋和太平洋鮭魚的病毒有關(guān),在那里它會(huì)造成嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失。
在下一步中,研究人員希望在實(shí)驗(yàn)室中培育病毒并調(diào)查為什么它只發(fā)生在阿爾卑斯河的某些部分以及全球魚類貿(mào)易在多大程度上促進(jìn)其傳播。
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