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        腹瀉病原體用RNA溫度計(jì)測(cè)量人體溫度

        利用尖端的高通量測(cè)序方法,研究人員立即繪制了腹瀉病原體的所有RNA結(jié)構(gòu)。在這個(gè)過(guò)程中,他們確定了許多溫度響應(yīng)結(jié)構(gòu),即所謂的RNA溫度計(jì)。“迄今為止,我們只是通過(guò)繁瑣的搜索發(fā)現(xiàn)了單獨(dú)的RNA溫度計(jì),并且一個(gè)接一個(gè)地進(jìn)行了精心分析,”來(lái)自波鴻魯爾大學(xué)的項(xiàng)目經(jīng)理Franz Narberhaus博士說(shuō)。結(jié)果由Bochum團(tuán)隊(duì)及其同事在Braunschweig的Helmholtz感染研究中心和萊比錫大學(xué)的“ 美國(guó)國(guó)家科學(xué)院院刊”上報(bào)告。

        腹瀉病原體用RNA溫度計(jì)測(cè)量人體溫度

        折疊的RNA結(jié)構(gòu)感知溫度

        多年來(lái),人們已經(jīng)知道某些細(xì)菌能夠通過(guò)體溫識(shí)別其溫血宿主的事實(shí)。其中包括鼠疫桿菌的近親,即Yersinia pseudotuberculosis,這是在該項(xiàng)目的過(guò)程中研究。在這個(gè)過(guò)程中,細(xì)菌使用折疊的RNA結(jié)構(gòu),在一定溫度下開始融化,因此揭示了難以接近的基因序列。然后可以將那些序列翻譯成控制疾病進(jìn)展的蛋白質(zhì)。

        建立了新方法

        為了檢測(cè)這種細(xì)胞溫度計(jì),研究小組部署了生化RNA 結(jié)構(gòu)探測(cè)和高通量測(cè)序的組合。因此,研究人員同時(shí)繪制了細(xì)菌細(xì)胞中包含的所有1,750個(gè)RNA結(jié)構(gòu)。他們?cè)谌齻€(gè)不同的溫度下進(jìn)行了實(shí)驗(yàn),并在每個(gè)實(shí)例中生成了RNA多樣性的快照。

        “這是我們觀察溫度升高時(shí)對(duì)RNA結(jié)構(gòu)的動(dòng)態(tài)修飾的方式,例如從25到37攝氏度,”在波鴻微生物生物學(xué)主席負(fù)責(zé)這個(gè)項(xiàng)目的博士生Francesco Righetti說(shuō)。

        “我們使用的方法非常耗時(shí)且昂貴,”Braunschweig的研究員Aaron Nuss博士說(shuō)。“然而,它為對(duì)RNA結(jié)構(gòu)的生物學(xué)功能感興趣的科學(xué)家提供了巨大的潛力。” 無(wú)論是否正在研究細(xì)菌,植物,動(dòng)物或人類細(xì)胞,該方法都是普遍適用的。

        許多溫度響應(yīng)基因

        “我們的研究結(jié)果表明,腹瀉病原體耶爾森菌假結(jié)核的數(shù)量驚人,直接對(duì)宿主的體溫產(chǎn)生反應(yīng),”Franz Narberhaus說(shuō)。研究人員選擇了20個(gè)基因用于后續(xù)實(shí)驗(yàn); 其中16個(gè)確實(shí)是溫度控制的。它們屬于不同的功能組。例如,一些參與細(xì)菌對(duì)氧化應(yīng)激的反應(yīng)。

        “為了面對(duì)人體胃腸系統(tǒng)的防御機(jī)制,在宿主感染后立即激活這些過(guò)程很有意義,”不倫瑞克感染生物學(xué)家Petra Dersch博士解釋道。

        目前的研究旨在揭示新鑒定的RNA結(jié)構(gòu)是否在感染期間起決定性作用。此外,研究人員打算查明是否存在能夠阻止RNA溫度計(jì)熔化的活性物質(zhì)。他們可能會(huì)干擾感染過(guò)程。

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