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        新研究揭示了甜瓜基因組的基因組結(jié)構(gòu)
        
			
        
				2018-12-18 13:24:24
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			  來源：
			
        
		
        
				
		
        
			
        來自意大利和西班牙的一組遺傳研究人員完成了對七個甜瓜品種基因組的第一次綜合分析。
        

        é???????????Cucumis melo L. var.makuwa?????? ????????￥?o????D???Hutchman / CC BY 2.0???
        

        科學(xué)家證明，高度栽培和繁殖的品系表現(xiàn)出最少的多樣性，野生瓜是最多樣化的。
        

        他們的研究在線發(fā)表在“分子生物學(xué)和進(jìn)化”雜志上，描述了超過430萬個單序列DNA變體，以及重要數(shù)量的結(jié)構(gòu)變異，包括缺失，倒位，重復(fù)和移動元素運(yùn)動。
        

        “這項(xiàng)研究揭示了甜瓜基因組的高度可塑性，并為未來的分析鋪平了道路，以解決甜瓜育種目標(biāo)，如提高水果質(zhì)量，或抵抗病蟲害，”研究資深作者Josep Maria Casacuberta博士說。來自西班牙巴塞羅那農(nóng)業(yè)基因組學(xué)研究中心。
        

        “從更廣泛的角度來看，需要進(jìn)行這樣的研究，以培育新的植物品種，以應(yīng)對農(nóng)業(yè)方面的挑戰(zhàn)，包括人口增長，土地和水資源短缺，以及氣候變化的未來影響。”
        

        總體而言，Casacuberta博士及其合作者發(fā)現(xiàn)了可能受DNA結(jié)構(gòu)變異影響的902個基因，其中53個基因被推定參與抗病性(29)，細(xì)胞壁代謝(10)，香氣揮發(fā)物代謝(9)，糖代謝( 4)和類胡蘿卜素的生物合成(1)。
        

        移動元素，稱為轉(zhuǎn)座子的基因跳躍結(jié)構(gòu)，在最近的甜瓜進(jìn)化過程中非?；钴S，該研究報(bào)告了許多轉(zhuǎn)座子插入，這些插入可能與重要農(nóng)藝性狀的變異性有關(guān)，甚至在兩個密切相關(guān)的精英品系之間也是如此。
        

        “代表物種多樣性的7個甜瓜品種中發(fā)現(xiàn)的變異性，包括野生種質(zhì)和高品種品系，相對較高，部分原因是某些譜系明顯不同。多樣性在基因組中非均勻地分布，在染色體的極端處較低并且在周圍區(qū)域中較高，這與在功能區(qū)域上純化選擇和重組力的效果相容。此外，這種可變性在精英品種中大大減少，可能是由于在育種過程中的選擇，“科學(xué)家說。
        

        “我們發(fā)現(xiàn)一些染色體區(qū)域顯示出優(yōu)良品種與其他品種的高度差異，這可以被認(rèn)為是強(qiáng)烈選擇的候選區(qū)域。”
        

        “我們的數(shù)據(jù)還表明轉(zhuǎn)座子和SV可能是甜瓜變異的重要部分的起源，這突出了分析所有類型的遺傳變異以理解作物基因組進(jìn)化的重要性。”
        
			

			
          
        
			
        
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