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        新的工具判斷計(jì)算機(jī)預(yù)測(cè)腫瘤遺傳多樣性的準(zhǔn)確性
        
			
        
				2020-01-14 10:39:41
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        癌癥通常由許多細(xì)胞組成，這些細(xì)胞在基因上彼此不同。這些基因差異意味著這種癌癥可能對(duì)某種治療特別敏感或有抵抗力。因此，識(shí)別這些變異可以幫助臨床醫(yī)生決定哪一種治療最可能對(duì)特定的病人成功。
        由于檢測(cè)遺傳變異的簡(jiǎn)單臨床方法容易丟失大量的細(xì)胞間變異，因此最近開發(fā)了計(jì)算機(jī)工具來預(yù)測(cè)和表征臨床腫瘤樣本中的遺傳多樣性。但是，目前還沒有通用的基準(zhǔn)測(cè)試方法來確定最精確的計(jì)算方法。
        這項(xiàng)發(fā)表在《自然生物技術(shù)》雜志上的研究開發(fā)了一種開源軟件，可以用來判斷計(jì)算機(jī)預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確性，并建立這一基準(zhǔn)。
        該團(tuán)隊(duì)開發(fā)了一個(gè)模擬框架和評(píng)分系統(tǒng)，以確定每個(gè)算法預(yù)測(cè)遺傳多樣性的各種指標(biāo)的準(zhǔn)確性。這些包括:腫瘤樣本中癌細(xì)胞的比例;腫瘤樣本中基因不同的癌細(xì)胞群的數(shù)量;每組細(xì)胞的比例;每組有哪些基因突變;以及群體之間的遺傳關(guān)系。
        我們的新框架提供了一個(gè)基礎(chǔ)，隨著時(shí)間的推移，它將對(duì)抗更多的腫瘤，有望成為一個(gè)急需的、公正的、黃金標(biāo)準(zhǔn)的基準(zhǔn)測(cè)試工具，用于評(píng)估旨在表征腫瘤遺傳多樣性的模型?！?/p>
        馬克西姆·塔拉比奇，聯(lián)合首席作者，克里克癌癥基因組實(shí)驗(yàn)室博士后。
        研究人員在現(xiàn)有的計(jì)算機(jī)軟件的基礎(chǔ)上生成并分析了本次研究中的580個(gè)預(yù)測(cè)，為軟件添加了新的功能，從而創(chuàng)造出更真實(shí)的腫瘤。這個(gè)腫瘤模擬軟件和評(píng)分框架是公開的，供其他研究人員直接使用或幫助開發(fā)他們自己的評(píng)分框架。
        癌癥基因組學(xué)中的計(jì)算機(jī)模擬正在幫助我們開發(fā)更精確的工具，因?yàn)槲覀兞私膺@些工具在哪些方面表現(xiàn)良好，哪些方面需要改進(jìn)。進(jìn)一步開發(fā)這些工具，使它們更接近現(xiàn)實(shí)生活中的腫瘤，最終將幫助臨床醫(yī)生更好地為患者提供個(gè)性化藥物?！?/p>			

			
          
        
			
        
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