新方法以單點精度敲除酵母基因
你如何讓酵母更加努力?不是制作面包,而是制作化學品和藥品的過程。工業(yè)目前使用稱為釀酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)的酵母。他們希望它能更好地發(fā)揮作用。答案是操縱酵母的遺傳密碼。為了獲得該代碼,研究人員開發(fā)了一種方法,可以關(guān)閉酵母中的靶基因,引入突變。該團隊的方法刪除了DNA序列中的特定點。他們研究每個缺失如何影響酵母。缺失會導(dǎo)致酵母停止使用某些化學物質(zhì)嗎?缺失會使酵母生長得更慢嗎?該團隊的方法讓他們研究每個基因,以及與其他基因的結(jié)合。通過這種方法,科學家們可以構(gòu)建突變體文庫,用于發(fā)現(xiàn)每個基因的工作原理。
到目前為止,遺傳突變文庫僅在較簡單的生物體中實現(xiàn),特別是原核生物。現(xiàn)在,科學家們可以為更復(fù)雜的生物建立這樣的庫。這項新技術(shù)讓科學家們可以快速設(shè)計出數(shù)以萬計的基因。他們可以98%的效率靶向基因。該結(jié)果易于鑒定和分離顯示出所需性狀的突變菌株,例如對生產(chǎn)工業(yè)產(chǎn)品所必需的有毒化合物的耐受性。
研究人員使用含有CRISPR指導(dǎo)序列的合成寡核苷酸(盒)文庫開發(fā)了一種稱為CRISPRCas9-和同源定向修復(fù)輔助基因組規(guī)模工程(CHAnGE)的方法,基因特異性序列可以針對那些選定基因進行同源重組,以及獨特的條形碼跟蹤每個突變株。將寡核苷酸文庫克隆到質(zhì)粒中并導(dǎo)入釀酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)中。合成了代表6500個酵母開放閱讀框中幾乎每一個的近25,000個序列。超過98%的CHAnGE盒導(dǎo)致靶基因突變至少82%的時間,表現(xiàn)出很高的編輯效率。該技術(shù)被證明對于引入小缺失和單堿基突變以及單個基因或結(jié)構(gòu)域的飽和誘變是有效的。CHAnGE成功應(yīng)用于設(shè)計耐糠醛的酵母菌株,表明它可用于工程相關(guān)的真核生物工程,以推進生物燃料和有價值化學品的可再生生產(chǎn)。
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