提出了蛋白質(zhì)復(fù)合物的周期表

今天發(fā)表在“ 科學(xué)”雜志上的蛋白質(zhì)復(fù)合物周期表提供了一種新的方式來觀察蛋白質(zhì)在自然界中可以構(gòu)建的各種結(jié)構(gòu)，接下來可能會發(fā)現(xiàn)這些結(jié)構(gòu)，并預(yù)測如何設(shè)計出完全新穎的結(jié)構(gòu)。該表由Wellcome Genome Campus和劍橋大學(xué)的研究人員領(lǐng)導(dǎo)的跨學(xué)科團隊創(chuàng)建，為進化和蛋白質(zhì)工程研究提供了寶貴的工具。

幾乎每個生物過程都依賴于蛋白質(zhì)以特定方式相互作用和組裝成復(fù)合物，并且許多疾病與復(fù)雜組裝中的問題相關(guān)。支持該組織的原則尚未完全了解，但通過定義蛋白質(zhì)復(fù)合物進化的基本步驟，新的“周期表”提供了蛋白質(zhì)組裝的系統(tǒng)，有序觀點，為理解生物功能提供了可視化工具。

“進化已經(jīng)產(chǎn)生了各種各樣的蛋白質(zhì)復(fù)合物，它看起來有點混亂，”以前來自惠康基因組校園和現(xiàn)在愛丁堡大學(xué)MRC人類遺傳學(xué)部門的Joe Marsh解釋道。“但如果你打破了蛋白質(zhì)成為復(fù)合物的步驟，那么有一些基本規(guī)則可以解釋人們迄今為止觀察到的幾乎所有組件。”

不同的舞廳舞蹈可以看作是少數(shù)基本步驟的無窮無盡的組合。類似地，蛋白質(zhì)復(fù)合物組裝的“舞蹈” 可被視為二聚化的無限變異(一個雙倍，變成兩個)，環(huán)化(一個形成三個或更多的環(huán))和亞基添加(兩個不同的蛋白質(zhì)相互結(jié)合) 。因為這些是以一種相當(dāng)可預(yù)測的方式發(fā)生的，所以它并不像你想象的那樣難以預(yù)測新蛋白質(zhì)是如何形成的。

“我們正在為混亂的蛋白質(zhì)復(fù)合物世界帶來大量的秩序，”劍橋大學(xué)卡文迪什實驗室的Sebastian Ahnert解釋說，他是一位經(jīng)常糾纏生物問題的物理學(xué)家。“蛋白質(zhì)可以繼續(xù)經(jīng)歷這些簡單步驟的多次迭代，增加越來越多的復(fù)雜程度并產(chǎn)生各種各樣的結(jié)構(gòu)。我們所做的是基于這些基本原則的分類，幫助人們處理復(fù)雜性。“

塞巴斯蒂安補充說，規(guī)則的例外情況本身就很有趣，正如正在進行的研究一樣。“通過分析已經(jīng)通過實驗確定三維結(jié)構(gòu)的成千上萬種蛋白質(zhì)復(fù)合物，我們可以看到發(fā)生的裝配過渡中的重復(fù)模式 - 并且通過質(zhì)譜的新數(shù)據(jù)，我們可以開始看到更大的圖像， “喬說。

“這項研究的核心工作是在理論物理和計算生物學(xué)方面，但如果沒有牛津大學(xué)同事的質(zhì)譜工作，就不可能做到這一點，”歐洲生物信息學(xué)研究所研究組組長Sarah Teichmann補充道。 -EBI)和Wellcome Trust Sanger Institute。“這是跨學(xué)科研究極為有價值的另一個很好的例子。”

鄭重聲明：本文版權(quán)歸原作者所有，轉(zhuǎn)載文章僅為傳播更多信息之目的，如有侵權(quán)行為，請第一時間聯(lián)系我們修改或刪除，多謝。

推薦內(nèi)容