一組科學(xué)家從新南威爾士大學(xué)悉尼,悉尼大學(xué),迪肯大學(xué),葡萄牙和巴西的甘蔗蟾蜍的DNA得到緩解,一種有毒的兩棲動(dòng)物,這是一個(gè)對(duì)許多澳大利亞本土物種的威脅。研究結(jié)果發(fā)表在學(xué)術(shù)期刊GigaScience今天。

“盡管其標(biāo)志性的地位,有很大的差距在我們對(duì)甘蔗蟾蜍遺傳學(xué)的理解,直到現(xiàn)在,還沒(méi)有人把基因組在一起,”彼得說(shuō)白色,項(xiàng)目負(fù)責(zé)人和新南威爾士大學(xué)微生物學(xué)和分子生物學(xué)教授。

十年前,研究人員在佤邦已經(jīng)試圖甘蔗蟾蜍的基因組序列,但他們遇到障礙時(shí)組裝,并沒(méi)有完成這個(gè)項(xiàng)目。

對(duì)于這個(gè)項(xiàng)目,悉尼UNSW-University團(tuán)隊(duì)在Ramaciotti新南威爾士大學(xué)基因組學(xué)中心,發(fā)揮了作用在其他澳大利亞標(biāo)志性物種的基因組解碼,包括考拉。

“測(cè)序和組裝基因組是一個(gè)復(fù)雜的過(guò)程。通過(guò)使用最先進(jìn)的測(cè)序技術(shù)和專業(yè)知識(shí)在新南威爾士大學(xué),我們360多億堿基對(duì)測(cè)序和組裝質(zhì)量最好的兩棲動(dòng)物基因組到目前為止,“高級(jí)講師豐富愛(ài)德華茲博士說(shuō),該研究的第一作者。

“我們?cè)O(shè)法破譯超過(guò)90%的甘蔗蟾蜍基因序列使用技術(shù),可以很長(zhǎng)的DNA片段,使基因組拼圖放在一起的任務(wù)變得更加容易。”

擁有一個(gè)草案甘蔗蟾蜍基因組將幫助關(guān)閉關(guān)鍵知識(shí)差距,加快甘蔗蟾蜍的研究。更多的蟾蜍現(xiàn)在可以測(cè)序的一小部分成本,自由和基因組available-anyone現(xiàn)在可以訪問(wèn),開(kāi)展進(jìn)一步的研究。

“未來(lái)的基因組分析將提供洞察甘蔗蟾蜍進(jìn)化和豐富我們對(duì)與在大型it生態(tài)系統(tǒng)的相互作用的理解將有助于我們理解利差的蟾蜍,它的毒素是如何工作的,并提供新的途徑來(lái)控制人口,“甘蔗蟾蜍專家說(shuō),從悉尼大學(xué)名譽(yù)教授里克發(fā)光。

“很少有兩棲動(dòng)物的基因組已經(jīng)測(cè)序迄今為止,所以這也是好消息兩棲動(dòng)物。有一個(gè)參考基因組可以提供寶貴的見(jiàn)解如何入侵物種進(jìn)化以適應(yīng)新環(huán)境。”

的基因組還將幫助研究人員找到新選項(xiàng)控制蟾蜍人口。

“當(dāng)前措施物理刪除沒(méi)有成功,但新方法教本地物種不吃蛤蟆大叫味道aversion-give新的希望。但是,我們需要更多的方法來(lái)控制這種入侵物種,”懷特教授說(shuō)。

對(duì)于這樣的一個(gè)替代measure-biocontrol,即使用一種病毒來(lái)幫助控制蟾蜍蟾蜍的老百姓造成的遺傳物質(zhì)是至關(guān)重要的。

“找到一個(gè)病毒生物防除,我們需要訪問(wèn)蟾蜍的DNA和RNA,”愛(ài)麗絲Russo解釋說(shuō),博士生在新南威爾士大學(xué)專門尋找潛在病毒控制蟾蜍。

“DNA包含古老的病毒DNA片段的動(dòng)物有時(shí)目錄過(guò)去感染。”

病毒曾被成功用于控制歐洲兔子人口。甘蔗蟾蜍病毒研究到目前為止的問(wèn)題是,他們可能會(huì)感染原生amphibians-which為什么這項(xiàng)研究旨在找到一種甘蔗t(yī)oad-specific病毒.

在本月發(fā)表的一篇論文病毒學(xué)雜志》上,研究人員描述他們?nèi)绾稳痈收狍蛤馨拇罄麃啅牟煌奈恢?使用結(jié)合DNA和RNA序列,發(fā)現(xiàn)了三種新的病毒。

“直到我們發(fā)表這篇文章,只有一個(gè)家庭的病毒會(huì)影響甘蔗蟾蜍。這是第一篇論文,發(fā)現(xiàn)不同的病毒,非常有前途的,”羅威說(shuō)。

“這篇論文已經(jīng)打開(kāi)了門:我們發(fā)現(xiàn)一種逆轉(zhuǎn)錄病毒,小核糖核酸病毒和圓環(huán)病毒基因類似于病毒感染的青蛙,爬行動(dòng)物和魚類。對(duì)于他們兩個(gè),我們發(fā)現(xiàn)一個(gè)完整的genome-both可能被用作生物防治劑。”

了解這些新病毒序列將幫助未來(lái)的研究將調(diào)查其患病率和生物電控制的潛在代理。

“還有很多工作要做。然而,這兩個(gè)文件是當(dāng)然這不是最重要的步驟在找到一個(gè)有效的方法來(lái)控制甘蔗蟾蜍,”懷特教授總結(jié)道。

甘蔗蟾蜍的適應(yīng)性很強(qiáng),對(duì)入侵地區(qū)的原生動(dòng)物造成破壞性的影響,其中有很多;他們目前在138個(gè)國(guó)家。介紹了自蟾蜍在昆士蘭的控制甘蔗甲蟲在1935年,它已經(jīng)蔓延widely-millions蟾蜍占據(jù)120萬(wàn)多平方公里。它致命的毒藥本地物種種,淡水鱷魚,和一些種類的原生蜥蜴和蛇。