重建深人口中美洲和南美洲的歷史

我們報告全基因組古DNA從49個人形成四個平行時間橫斷面在伯利茲,巴西、中央安第斯山脈和南錐,每個可以追溯到至少9000年前∼。的祖先群體輻射迅速從早期的兩個分支,導(dǎo)致今天的印第安人。我們之前從未見過文檔兩個流北美和南美之間的基因流動。影響中央安第斯山脈的∼4200年前,而另一解釋北美最古老的基因組之間的親和力與克洛維斯文化和最古老的中部和南部的美國人從智利,巴西,和伯利茲。然而,這并不是后來南美的主要來源,隨著其他古代個人來自血統(tǒng)沒有特定親和力Clovis-associated基因組,建議至少在9000年前開始的人口置換,緊隨其后的是大量人口連續(xù)性在多個區(qū)域。

人類學(xué)

介紹

基因研究的現(xiàn)代和古代印第安人表明,絕大多數(shù)在美國非北極原住民源自祖先的齊次祖先的人口。這人口的多樣化17500 - 14600日歷年禮物(BP)(Moreno-Mayar et al .,2018 a

)分為兩個分支,被稱為“南方印第安人”或“祖先”(ANC-A)和“北部印第安人”或“B祖先”(ANC-B)(Moreno-Mayar et al .,2018 A

Raghavan et al .,2015

拉斯穆森et al .,2014

,2012年帝國等。

,斯蓋布et al .,2018

)。個人約會從Anzick∼12900 - 12700 BP與克洛維斯文化相關(guān)的網(wǎng)站在蒙大拿和ANC-A血統(tǒng),也很大程度反映在今天的中部和南部的美國人在古老的加州人。相比之下,ANC-B祖先嚴重代表在北美東部和古人從安大略西南部(斯蓋布et al .,2018

)。原始記錄的研究這兩個深血統(tǒng)適合模型完全ANC-A中部和南部的美國人的祖先(Rasmussen et al .,2014

,2012年帝國等。

)。然而,斯蓋布et al .(2018)

建議所有美國中部和南部港口大量比例的血統(tǒng)(至少每個∼30%)。

最近的分析也表明,一些組織在巴西和澳洲人分享更多的等位基因(新幾內(nèi)亞土著,澳大利亞人,安達曼群島島民)(Raghavan et al .,2015

Skoglund et al .,2015

來自中國北方的)和一個∼40000個基點個人(楊et al .,2017

)比其他中部和南部的美國人。這樣的模式表明,這些團體并不完全來自一個同質(zhì)性,而是源于人口的混合物,其中,人口Y,生了一個獨特的澳洲人的親和力。值得注意的是,我們的研究包括數(shù)據(jù)從個人如拉做圣網(wǎng)站有顱形態(tài)被稱為“Paleoamerican”認為,表示兩個不同的New-World-founding人口(馮Cramon-Taubadel et al .,2017

)。這里,我們直接測試的假設(shè)Paleoamerican顱形態(tài)與血統(tǒng)不同導(dǎo)致的其他印第安人(無論該人口Y或其他)。

本研究前,公布的數(shù)據(jù)來自中美洲和南美洲最后一年以上僅限于兩個低覆蓋率的基因組(Raghavan et al .,2015

)。在這里,我們報告全基因組數(shù)據(jù)從伯利茲49個人,巴西,秘魯,和南錐(智利和阿根廷),41歲以上1000年,每一次橫斷面開始在10900 - 8600個基點(圖1;表S3)。獲得這些數(shù)據(jù),我們與政府機構(gòu)和土著人民合作,確定樣品,準備從骨骼材料,提取DNA(Dabney et al .,2013

),生成單和雙鏈DNA庫,其中大部分我們對待酶uracil-DNA糖基化酶(UDG)減少特征的古代DNA錯誤(Gansauge和梅耶,2013

Rohland et al .,2015

)。我們?yōu)閙tDNA豐富,∼120萬個snp(Fu et al .,2015

)和測序的豐富圖書館Illumina公司儀器(表S3;星方法)。我們結(jié)合古代和現(xiàn)在的數(shù)據(jù)來研究基因變化在過去的11000年。

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