25個基因組項目揭示了25種
為了紀念Wellcome Trust Sanger Institute于2018年年滿25歲,該研究所及其合作者正在對英國25種新的物種基因組進行測序。最近的五個物種現(xiàn)已被全球數(shù)以千計的學童和公眾選中,他們參與了25個基因組項目的在線投票。
該項目可以揭示為什么一些褐鱒遷移到開闊的海洋,而另一些則沒有,或者告訴我們更多關于知更鳥眼中的磁感受器,讓他們“看到”地球的磁場。它還可以解釋為什么紅松鼠容易受到松鼠痘病毒的攻擊,但灰松鼠可以攜帶并傳播病毒而不會生病。
所有結果都將公之于眾,并將導致未來的研究,以了解英國的生物多樣性,并有助于保護和了解這些物種。
桑格研究所由Sir John Sulston教授于1993年創(chuàng)立,作為人類基因組計劃的一部分。該研究所對第一個人類基因組的金標準序列作出了最大的單一貢獻,該序列于2003年出版。
基因組是生物體用DNA編寫的完整遺傳指令集。每個基因組都包含構建該生物體并使其生長和發(fā)育所需的所有信息。
自人類基因組標志性建成以來,桑格研究所已成為全球公認的基因組學領域的領導者。許多更重要的參考基因組已經(jīng)被測序 - 從小鼠和斑馬魚基因組到豬,大猩猩,蚊子和許多其他基因組。除動物物種外,傳染病和細菌在參考基因組列表中也占有突出地位,從沙門氏菌和MRSA到衣原體和瘧疾。所有這些都提供了關于這些物種在健康和疾病方面的重要見解。
現(xiàn)在,桑格研究所及其合作伙伴正在全面測序來自英國的25種物種。該項目對更大規(guī)模的事業(yè)做出了微小的貢獻,來自世界各地的科學家聚集在一起制定了一個計劃,對地球上的所有生命進行排序。
PacBio®長讀序列技術使該項目成為可能,該技術可生成高質量的基因組。該研究所正在與PacBio和其他技術領域的領導者10x Genomics和Illumina合作,以創(chuàng)建這些基因組的最全面的視圖。
高質量的基因組將為科學家們利用這些信息敞開大門,研究人員可以發(fā)現(xiàn)英國物種如何應對環(huán)境壓力,以及他們在遺傳學中保持什么秘密,使他們能夠蓬勃發(fā)展或掙扎。
根據(jù)它們所具有的品質,這25種物種分為五類:蓬勃發(fā)展,英國種類繁多;瀕臨滅絕,瀕危和衰落的物種;危險,侵入性和有害物種;我們都認識到的標志性的,典型的英國物種;隱秘的物種,僅憑外觀就看不見或與其他物種無法區(qū)分。
將對其基因組進行測序的25種物種是:
蓬勃發(fā)展的物種:
灰松鼠
小環(huán)蝴蝶
羅塞爾的布什 - 板球
牛津狗舌草
萎靡的物種:
紅松鼠
水田鼠
龜鳩
北二月紅鶇
危險物種:
巨人Hogweed
印度苦瓜
King Scallop,也被稱為Great Scallop,Coquilles Saint-Jacques
新西蘭扁蟲
標志性物種:
金鷹
黑莓
歐洲羅賓
紅梅森蜜蜂
隱秘物種:
褐鱒魚
普通Pipistrelle蝙蝠
Carrington的Featherwort
夏天松露
公眾選擇的五種:
常見的海星
芬筏蜘蛛
小斑點Catshark
亞洲大黃蜂
歐亞水獺
Wellcome Trust Sanger研究所所長Mike Stratton教授說:“二十五年前,基因組學領域是一個萌芽的想法,其意義只是夢想的。今天,基因組學和生物數(shù)據(jù)的現(xiàn)實是它正在改變我們的理解,疾病的診斷和治療,從癌癥和心臟病到瘧疾和感染。推動這一發(fā)現(xiàn)時代的科學和技術正在加速我們對人體的理解,也加速了我們對周圍世界的理解。
這個項目是在世界各地進行了許多深思熟慮的談話之后,關于我們這個星球上有多少物種可以在未來幾十年內(nèi)進行排序 - 原則上,所有這些都是如此。我們正在著手為地球上所有生命的排序做出貢獻。“
Wellcome Trust Sanger研究所副主任Julia Wilson博士說:“通過對這25個基因組進行測序,科學家將更好地了解英國物種,它們是如何到達這里的,它們的進化以及不同物種如何適應不斷變化的環(huán)境結果可以揭示這些物種中隱藏的真相,并使科學界能夠了解我們的世界如何在我們周圍不斷變化和發(fā)展。我們希望以特殊的“桑格”方式慶祝桑格研究所成立25周年,我很高興看到25基因組計劃如何展開。“
Wellcome基因組校區(qū)公共參與負責人Ken Skeldon表示:“讓公眾有機會選擇在25個基因組計劃中對哪些物種進行基因組測序,這為該項目帶來了新的視角。我們很高興看到這么多人與學校的孩子在英國及以后積極參與了與科學家們在線聊天和投票最后五種。”
自然歷史博物館生命科學負責人蒂姆·利特伍德說:“自然歷史博物館很自豪能與桑格研究所合作慶祝他們的25歲生日,并慶?;蚪M測序等分子技術可以帶來的進步。研究英國野生動物。我們關注的8000萬個標本來自世界各地,擁有豐富的遺傳信息,使我們能夠進行創(chuàng)新研究,應對全球挑戰(zhàn)。特別歡迎利用尖端技術關注英國生物多樣性。“
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