Chan Zuckerberg Biohub推出Tabula Muris 一個開源的小鼠細(xì)胞數(shù)據(jù)庫
來自斯坦福大學(xué),Chan Zuckerberg Biohub,VA Palo Alto醫(yī)療保健系統(tǒng)和加利福尼亞大學(xué)的一個龐大的研究團(tuán)隊(duì)組建了一個名為Tabula Muris的小鼠細(xì)胞信息的開源數(shù)據(jù)庫。在他們發(fā)表在Nature雜志上的論文中,該小組描述了如何獲得數(shù)據(jù)庫中的信息以及如何使用它。
隨著生物學(xué)研究的進(jìn)展,科學(xué)家們發(fā)現(xiàn)在研究特定生物的生物學(xué)時,獲得更廣泛的動物視角是有用的。在這項(xiàng)新計劃中,該團(tuán)隊(duì)通過逐個細(xì)胞地創(chuàng)建有關(guān)它們的信息數(shù)據(jù)庫,力求讓研究人員更全面地了解老鼠的生物學(xué)。為此,他們使用兩種方法從20個小鼠器官中分離出100,000多個細(xì)胞。第一種方法稱為熒光激活細(xì)胞分選(FACS),用于分離44,949個細(xì)胞,而微流體液滴技術(shù)用于分離另外55,656個細(xì)胞。從幾只三個月大的小鼠中分離細(xì)胞,為研究人員提供健康小鼠細(xì)胞生物學(xué)的路線圖。
從動物身體的所有部位分離細(xì)胞并將細(xì)節(jié)放入數(shù)據(jù)庫中,研究人員可以以新的方式研究動物的生物學(xué)。對阿爾茨海默病的小鼠模型這樣做可以揭示整個小鼠的變化,例如,而不僅僅是它的大腦或血液。它提供了更多地了解這種疾病的可能性,以及它如何以更全身的方式影響老鼠,以及它對人類的影響。它也可能導(dǎo)致更好地了解其原因,并可能導(dǎo)致預(yù)防或治愈。該數(shù)據(jù)庫可以被用于研究范圍廣泛的疾病,包括糖尿病,心臟疾病,甚至癌癥。
該小組建議他們的數(shù)據(jù)庫可以作為全球生物醫(yī)學(xué)研究人員的新工具。這項(xiàng)工作由Chan Zuckerberg Biohub贊助。該組織還支持人類細(xì)胞地圖集 - 一種旨在繪制該組織所描述的“生活的基本單位”的國際合作。
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