關(guān)于昆蟲DNA分析和生物多樣性估計(jì)的新討論
面對(duì)全球昆蟲數(shù)量不斷減少,科學(xué)家們不斷擴(kuò)大我們對(duì)全球無(wú)脊椎動(dòng)物及其生物多樣性的認(rèn)識(shí)。昆蟲是地球上最豐富的動(dòng)物 - 它們超過全人類17倍。它們的豐富性,多樣性和普遍性意味著昆蟲在食物網(wǎng)和生態(tài)系統(tǒng)中起著基礎(chǔ)作用,從授粉糧食作物花卉的蜜蜂到回收死樹的白蟻。隨著世界范圍內(nèi)昆蟲種群的減少,仍然有新的物種被發(fā)現(xiàn)。
遠(yuǎn)程森林覆蓋的新西蘭Hauturu島(也稱為L(zhǎng)ittle Barrier Island)的研究人員利用DNA測(cè)序編制了一份驚人的無(wú)脊椎動(dòng)物生物多樣性清單,向GenBank添加了大量無(wú)脊椎動(dòng)物- 所有公開DNA序列的開放獲取數(shù)據(jù)庫(kù)。結(jié)果發(fā)表在本周美國(guó)生態(tài)學(xué)會(huì)的“ 生態(tài)應(yīng)用 ”雜志上。
全球存在的無(wú)脊椎動(dòng)物物種的數(shù)量是不確定的,并且難以使用需要由專家分類學(xué)家檢查個(gè)體標(biāo)本的傳統(tǒng)方法來(lái)表征整個(gè)無(wú)脊椎動(dòng)物群落。
這就是DNA測(cè)序的用武之地。這種方法被譽(yù)為解決地球未充分探索的生態(tài)系統(tǒng)生物多樣性的工具。它允許基于更有效的分子分析來(lái)鑒定無(wú)脊椎動(dòng)物標(biāo)本。
奧克蘭大學(xué)的研究員Andrew Dopheide及其同事將老式野外生物學(xué)與下一代DNA測(cè)序結(jié)合起來(lái),探索利用組合數(shù)據(jù)集作為估計(jì)Hauturu島上無(wú)脊椎動(dòng)物總生物量的基礎(chǔ)。他們從落葉樣品,陷阱陷阱和土壤本身收集標(biāo)本。
“在新西蘭的背景下,我們并未發(fā)現(xiàn)任何其他基于生態(tài)系統(tǒng)的基于DNA的陸地?zé)o脊椎動(dòng)物生物多樣性調(diào)查,”Dopheide解釋說。“此外,沒有關(guān)于Hauturu無(wú)脊椎動(dòng)物生物多樣性的信息,盡管這是新西蘭最原始和最重要的自然生態(tài)系統(tǒng)之一。”
在研究結(jié)束時(shí),他們估計(jì)地上無(wú)脊椎動(dòng)物群落包括超過1000種節(jié)肢動(dòng)物物種(具有外骨骼,分段的身體和成對(duì)的關(guān)節(jié)附肢),其中770種是昆蟲,344種是甲蟲。
他們測(cè)序的土壤產(chǎn)生了更豐富的樣本。土壤是生物多樣性 DNA分析的有前途的基礎(chǔ),因?yàn)樗鼈儼喾N生物群落以及包括DNA分子在內(nèi)的生物碎片??茖W(xué)家對(duì)土壤群落的了解遠(yuǎn)不如地上社區(qū)。
從土壤樣本中他們能夠估計(jì)出6856種節(jié)肢動(dòng)物(不包括螨蟲),其中近4000種是昆蟲。
甲蟲(命令鞘翅目)最豐富,其次是鋸蠅,黃蜂,蜜蜂和螞蟻(命令膜翅目),蒼蠅(雙翅目),蝴蝶和飛蛾(鱗翅目)和各種Amphipoda-一種多樣的小型蝦類甲殼類動(dòng)物主要發(fā)生在海洋中,也發(fā)生在淡水和一些陸地棲息地。
他們總共向GenBank添加了2500多個(gè)新的DNA序列,GenBank收集了來(lái)自100,000多種不同生物的數(shù)據(jù),并已成為生物學(xué)領(lǐng)域研究的重要數(shù)據(jù)庫(kù)。
“我們感到驚訝的是,很少有無(wú)脊椎動(dòng)物已經(jīng)在GenBank中代表,”多普海德說,“這表明盡管使用了非常傳統(tǒng)的采集方法,我們已經(jīng)恢復(fù)了大部分新的或研究很少的物種,并強(qiáng)調(diào)缺乏對(duì)這些重要的知識(shí)有機(jī)體...... GenBank中沒有DNA序列的許多無(wú)脊椎動(dòng)物確實(shí)是新物種,但我們不確定。“
隨著全世界昆蟲種群的減少,至少仍有新物種被測(cè)序和記錄。這項(xiàng)工作由Dopheide等人完成。標(biāo)志著這條道路,并設(shè)置了標(biāo)準(zhǔn),將古老的自然科學(xué)與DNA測(cè)序相結(jié)合,以描述主導(dǎo)生態(tài)系統(tǒng)結(jié)構(gòu)和功能的物種 ......同時(shí)驚嘆于其中有多少是甲蟲。
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