新的重編程因子產(chǎn)生更有效的人多能干細胞誘導
阿拉巴馬大學伯明翰分校的Kejin Hu博士發(fā)現(xiàn)了一種強大的重編程因子,可以將皮膚成纖維細胞產(chǎn)生人誘導多能干細胞(HiPSCs)的效率提高20倍以上,加快重編程時間幾天,提高重編程的質(zhì)量。據(jù)信,HiPSC在醫(yī)學研究和疾病治療方面具有很大的前景。它們是人類胚胎干細胞(hESCs)的人造版本。生物醫(yī)學研究人員可以從許多體細胞產(chǎn)生HiPSC,例如來自皮膚活檢的成纖維細胞,而不會破壞任何人類胚胎。與hESC一樣,HiPSC具有分化成任何類型的特化細胞的能力。因此,它們可以分化成200多種不同類型的人類細胞中的任何一種。這些細胞是藥物開發(fā)和疾病建模的有效工具,它們還具有通過創(chuàng)建患者特異性多能干細胞來轉(zhuǎn)化移植醫(yī)學的潛力。用于細胞替代療法。目標可能包括神經(jīng)系統(tǒng)疾病,心臟病,血液病和糖尿病。但是,生產(chǎn)這些細胞時,iPSC的這種承諾受到低效率(小于0.1%至1%)的阻礙,以及許多其他重大障礙。
在3月7日Nature Nature上發(fā)表的一篇論文中,Hu和其他UAB研究人員描述了他們成功尋找一種重編程因子,該因子提高了效率,縮短了細胞重編程所需的時間。重編程因子是稱為BRD3R的激酶家族蛋白,其讀取染色體中的乙酰化組蛋白密碼。
當胡實驗室觀察人類成纖維細胞重編程為iPSCs過程中BRD3R過表達誘導的基因表達時,他們也解開了自1962年諾貝爾獎得主約翰古爾登首次克隆青蛙以來經(jīng)歷了半個世紀的謎團。腸細胞核進入去核蛙卵細胞 - 即為什么動物克隆只能在有絲分裂中期II階段的卵母細胞中成功?Hu發(fā)現(xiàn)BRD3R基因在引入成纖維細胞時,上調(diào)了128個有絲分裂基因,從而對重編程的有絲分裂優(yōu)勢產(chǎn)生了分子洞察力。
“當我們看到mRNA測序數(shù)據(jù)時,他們解釋了為什么有絲分裂在重編程中如此重要,”胡說。“當我們發(fā)現(xiàn)一種新的重編程因子時,我很興奮,也是第二次發(fā)現(xiàn)。”
為了重新編程成纖維細胞,Hu實驗室使用了由慢病毒載體遞送的BRD3R,以及日本諾貝爾獎獲得者Shinya Yamanaka在2006年首次成功將成熟小鼠細胞重編程為iPSC-OCT4,SOX2和KLF4中使用的三種基因。BRD3R無法取代三種必需的Yamanaka重編程因子中的任何一種,表明BRD3R在重編程中具有獨特的作用。胡和他的同事們在無異種培養(yǎng)基中對人體細胞進行了重編程,沒有使用任何來源的小鼠飼養(yǎng)細胞或血清。無異種生產(chǎn)將成為FDA對人類iPSC未來臨床應用的良好生產(chǎn)實踐要求。
在2011年到達干細胞研究所,UAB生物化學和遺傳學系后,胡開始尋找新的重編程因子。“我相信新的重編程因子會以更有效,更快的方式產(chǎn)生更多真正的iPSC。”
他獲得了558個人類激酶基因的文庫,并開始篩選一批89個。在將三個Yamanaka基因和他的測試激酶基因?qū)氤衫w維細胞后,他尋求提高iPSC生成的效率,通過增加判斷成功重編程的多能細胞的集落數(shù),表達多能標記堿性磷酸酶和TRA-1-60。胡的主屏幕顯示了11個候選人,但只有BRD3R在更嚴格的二級屏幕中充當了新的重編程因子。
沒有與BRD3R-BRD2,BRD3和BRD4相似的BET亞家族基因顯示出重編程活性。由標準標準顯示BRD3R產(chǎn)生的iPSC是多能的。盡管BRD3R是激酶文庫的成員,但尚未證實其具有激酶活性。但是,在重編程的早期階段,BRD3R最一致上調(diào)的基因是編碼四種激酶的基因,包括主要的有絲分裂激酶和關(guān)鍵的有絲分裂激酶,五種調(diào)節(jié)激酶活性的基因和一種磷酸酶基因。因此,Hu及其同事寫道,“即使BRD3R可能沒有激酶活性,它似乎可以調(diào)節(jié)一種重要的有絲分裂激酶網(wǎng)絡以促進重編程。”
在干細胞與發(fā)育同時發(fā)表的另一篇論文中,胡的實驗室報告了一個有希望的解決方案,解決與人類iPSC的臨床應用相關(guān)的問題。HiPSC像癌細胞一樣具有猖獗的生長,并且基于HiPSC的移植物中單個HiPSC細胞的污染將導致受體患者腫瘤發(fā)展的風險。此外,不完全分化的HiPSC也被認為是致瘤的?;贖iPSC的細胞療法已經(jīng)進入臨床試驗,沒有安全方案可以消除接受基于HiPSC的移植患者腫瘤發(fā)展的風險。胡的研究的一個目標是建立協(xié)議,以消除基于HiPSC的移植中的致瘤細胞。他的實驗室發(fā)現(xiàn),使用成熟的抗體靶向HiPSC標記表面蛋白PODXL會殺死多能細胞。
“我們建議,”作者寫道,“該抗體可用于消除人類PSC衍生細胞中的致瘤多能細胞,用于細胞移植。”
已知PODXL涉及10多種不同的人類惡性腫瘤,并且在轉(zhuǎn)移和腫瘤侵襲中具有報道的作用。胡的實驗室有興趣發(fā)現(xiàn)相同的抗體是否可以殺死癌癥患者的其他惡性細胞。
Hu及其同事發(fā)現(xiàn)PODXL在HiPSCs中具有高基因表達,并且當細胞分化時它被下調(diào)。他們最近發(fā)現(xiàn)殘留的PODXL陽性人群即使在延長分化后仍然存在。胡說,迫切需要檢查基于HiPSC的移植物中殘留的PODXL陽性細胞群的致瘤性。
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