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        桃基因組為生物燃料作物的育種策略提供了見解
        
			
        
				2019-01-02 15:01:58
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        快速生長的樹木如楊樹和柳樹是候選“生物燃料作物”，預計可以有效地提取纖維素乙醇和更高能量含量的燃料。對這些作物進行馴化需要對樹木的生理學和遺傳學有深入的了解，科學家們正在轉向長馴化的果樹以尋求提示。桃子和楊樹之間的關系乍一看可能并不明顯，但對于植物學家來說，兩棵樹都是玫瑰花超家族的一部分，其中不僅包括蘋果，草莓，櫻桃和杏仁等水果作物，還包括許多其他植物。包括玫瑰在內(nèi)的超級家族的名字。
        

        桃基因組為生物燃料作物的育種策略提供了見解
        

        美國能源部聯(lián)合基因組研究所(DOE JGI)工廠項目負責人，哈德遜阿爾法生物技術研究所的教員調(diào)查員Jeremy Schmutz說：“桃子和白楊樹之間的密切關系可以從他們的DNA序列中看出來。”
        

        在3月24日的Nature Genetics版本中，Schmutz和幾位同事參與了國際桃子基因組計劃(IPGI)，該計劃發(fā)布了Lovell品種Prunus persica的2.65億基礎基因組。
        

        “使用比較基因組學方法，桃子序列的表征不僅可以用于桃子和其他重要樹種的改良和可持續(xù)性，而且可以增強我們對樹木基本生物學的理解，”該團隊寫道。他們將141個桃基因家族與其他6個完全測序的不同植物物種進行了比較，以揭示獨特的代謝途徑，例如那些導致木質(zhì)素生物合成的途徑 - 將植物細胞固定在一起的分子“膠水” - 以及解構的關鍵障礙生物質(zhì)轉化為燃料
        

        對于生物能源研究人員來說，桃子基因組的大小使其成為研究相關基因組中發(fā)現(xiàn)的基因的植物模型的理想選擇，例如白楊，美國能源部JGI的植物旗艦基因組之一，并開發(fā)用于提高生物燃料的植物生物量產(chǎn)量的方法。
        

        “我們感興趣的一個基因是桃子中所謂的”常綠“基因座，它延長了生長季節(jié)，”DOE JGI真核計劃負責人Daniel Rokhsar說道，他在2007年開始對桃子基因組進行測序。“從理論上講，它可以在楊樹中進行操作，以增加生物量的積累。“
        

        該出版物是在國際桃子基因組聯(lián)盟在DOE JGI工廠門戶網(wǎng)站Phytozome.net和其他網(wǎng)站上公開發(fā)布注釋桃基因組裝配草案三年后出版的。決定對桃基因組進行測序是在2007年植物和動物基因組XI會議期間首次公布的。
        
			

			
          
        
			
        
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