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        基因組學(xué)公共衛(wèi)生和考古學(xué)領(lǐng)域相結(jié)合
        
			
        
				2018-12-25 09:39:32
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        10月底，來自加拿大，德國和美國的一組科學(xué)家發(fā)表了一篇論文，與基因組學(xué)，公共衛(wèi)生和考古學(xué)領(lǐng)域相結(jié)合。
        

        該團(tuán)隊(duì)由德國蒂賓根大學(xué)的Johannes Krause和加拿大麥克馬斯特大學(xué)的Hendrik Poinder領(lǐng)導(dǎo)，他們報(bào)告說他們能夠?qū)ω?fù)責(zé)黑死病的細(xì)菌的全基因組進(jìn)行測(cè)序，這是一場(chǎng)從1347年席卷歐洲的瘟疫 - 1351年，殺死30%至50%的人口。
        

        基因組學(xué)公共衛(wèi)生和考古學(xué)領(lǐng)域相結(jié)合
        

        這項(xiàng)研究結(jié)果來自于從倫敦瘟疫坑中回收的幾顆牙齒中提取的DNA。倫敦的受害者在14世紀(jì)如此迅速地堆積起來 - 在瘟疫高度每天約200人 - 教會(huì)官員組織了集體墳?zāi)够蛭烈呖?。本研究中使用的DNA來自倫敦金融區(qū)中心的東史密斯菲爾德(East Smithfield) - 現(xiàn)在實(shí)際上位于舊的皇家造幣廠(Royal Mint)。
        

        可用于測(cè)序DNA的技術(shù)現(xiàn)在非常敏感，只要存在可回收的DNA，就可以從古代樣品中分析DNA。被稱為古生物基因組學(xué)，該地區(qū)的工作開始尋求揭示埃及木乃伊的秘密，并從那時(shí)起被用于史前的樣本，特別是毛茸茸的猛犸象，以及最近的尼安德特人。這些樣本數(shù)萬年，而在這種情況下，回收細(xì)菌DNA的牙齒僅追溯到約660年。然而，重建古代細(xì)菌基因組的序列比哺乳動(dòng)物更難，因?yàn)榧?xì)菌基因組要小得多，土壤細(xì)菌的污染更難以過濾掉。
        

        確定近700年前發(fā)生的鼠疫的確切原因是自基因組學(xué)問世以來最近才成為可能的事情 - 尤其是NextGen技術(shù)的開發(fā)，這些技術(shù)不依賴于DNA擴(kuò)增和聚合酶鏈反應(yīng)技術(shù)，可以增加污染。一段時(shí)間以來，研究人員認(rèn)為瘟疫是由一種叫做鼠疫耶爾森氏菌的細(xì)菌引起的，但是。鼠疫我們?nèi)匀缓臀覀冊(cè)谝黄?，雖然它引起了腹部和肺炎的瘟疫，但這種爆發(fā)與黑死病幾乎沒有相同的嚴(yán)重程度(甚至是相同的癥狀范圍)，導(dǎo)致一些歷史學(xué)家和科學(xué)家對(duì)于真正的致病罪魁禍?zhǔn)?。歷史學(xué)家已經(jīng)能夠通過歷史記錄繪制疾病的過程; 當(dāng)代對(duì)癥狀的描述，讓我們了解受害者一旦受到感染的命運(yùn); 和埋葬記錄，讓我們了解從城鎮(zhèn)到城鎮(zhèn)的傳播速度以及瘟疫到來后的高死亡率。
        

        利用從鼠疫坑中回收的鼠疫桿菌的基因組序列，研究人員能夠?qū)⑵渑c當(dāng)前鼠疫桿菌菌株的基因組序列一起使用，以創(chuàng)建系統(tǒng)發(fā)育樹，從那時(shí)起映射病原體的進(jìn)化。分析將Black Death Y. pestis放在這棵進(jìn)化樹的根部附近，這表明黑死病是人類第一次與這種蟲子相遇。
        

        這種古老版本的鼠疫菌與當(dāng)前菌株的比較分析表明，在14世紀(jì)，由于細(xì)菌的遺傳密碼幾乎沒有變化，因此很少有基因組線索。相反，作者認(rèn)為黑死病的可怕代價(jià)可能是由于其他一些因素造成的。當(dāng)時(shí)不良的衛(wèi)生和公共衛(wèi)生可能是一個(gè)因素，也是人口的遺傳構(gòu)成。很可能這些受害者中的許多人對(duì)這種疾病的易感性更高，他們的死亡人數(shù)增加了最能抵抗的人口比例，這可能解釋了為什么最近爆發(fā)的疫情幾乎不可怕。
        

        并且，為了避免這似乎是對(duì)一些歷史事件的學(xué)術(shù)研究，它不是。其他研究人員最近報(bào)道，今年早些時(shí)候在德國引起特別令人討厭的食源性疾病爆發(fā)的大腸桿菌菌株含有來自原始鼠疫細(xì)菌的DNA序列。黑死病的比特可能仍然潛伏著，等著讓我們生病。
        
			

			
          
        
			
        
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