NHGRI史密森尼序列可能是北美最古老的狗類(lèi)遺物
十一萬(wàn)年前,古印第安人在科羅拉多州東北部的干草原上漫步,尋找數(shù)量逐漸減少的猛犸象和更豐富的野牛群。這些獵人使用了在他們的殺戮地點(diǎn)發(fā)現(xiàn)的矛頭和箭尖 - 稱(chēng)為Folsom點(diǎn)。
1974年,史密森尼學(xué)會(huì)國(guó)家自然歷史博物館(NMNH)的考古學(xué)家,古印度/古生物學(xué)項(xiàng)目主任丹尼斯斯坦福博士對(duì)其中一個(gè)地點(diǎn)進(jìn)行了全面挖掘,稱(chēng)為瓊斯 - 在科羅拉多州尤馬縣的米勒地獄峽谷野牛殺戮地點(diǎn)。他們發(fā)現(xiàn)野牛遺骸和Folsom點(diǎn),但該遺址還包含狗遺骸??脊艑W(xué)家們拯救了這一系列古老的影響,但直到幾個(gè)月前,這些狗骨頭仍未被觸及。
然后,在2014年春天,斯坦福博士參加了NHGRI癌癥遺傳學(xué)和比較基因組學(xué)分會(huì)的高級(jí)研究員Elaine Ostrander博士的關(guān)于犬(狗)基因組學(xué)的討論。Ostrander博士談到了她對(duì)影響狗和人類(lèi)疾病發(fā)展的基因的研究。她的演講“狗基因組:人類(lèi)疾病的曙光”是NHGRI-NMNH展覽“ Genome:Unlocking Life's
斯坦福博士意識(shí)到NMNH收集古代狗骨頭對(duì)犬基因組研究的潛在重要性,但直到最近,科學(xué)家還沒(méi)有使用古代DNA或狗基因組完整序列所需的工具或技術(shù)。 (2005年出版)他們可以比較古代的狗DNA。
2014年8月,由于這種認(rèn)識(shí),Ostrander博士檢查了古老的狗骨頭。在同一次訪問(wèn)中,Klaus Koepfli博士 史密森尼保護(hù)生物學(xué)研究所,物種生存保護(hù)中心和Brennan Decker,MD / Ph.D. NIH-劍橋?qū)W者計(jì)劃的候選人幫助鉆取骨骼并提取小樣本,這些樣本后來(lái)可用于分離DNA。
Ostrander博士與加州大學(xué)洛杉磯分校(UCLA)生態(tài)與進(jìn)化生物學(xué)系教授Robert Wayne博士長(zhǎng)期合作,他是一位專(zhuān)攻古代DNA的實(shí)驗(yàn)室的負(fù)責(zé)人。 。他的實(shí)驗(yàn)室擁有進(jìn)行易碎樣品DNA提取所必需的無(wú)菌設(shè)施。Ostrander博士和她的團(tuán)隊(duì)將在韋恩博士的邀請(qǐng)下前往加州大學(xué)洛杉磯分校,從狗骨中分離DNA,為基因組測(cè)序做準(zhǔn)備。
根據(jù)奧斯特蘭德博士的說(shuō)法,這些骨骼的形狀非常好:牙齒附著在頭骨上,趾甲仍然完好無(wú)損,多個(gè)連續(xù)的骨骼以正確的順序存在,并且可以看到不同水平的骨骼結(jié)構(gòu)。來(lái)自25至30個(gè)樣本的DNA可以揭示狗與現(xiàn)今品種相比的樣子。此外,DNA可以通過(guò)在時(shí)間和背景中放置早期馴養(yǎng)的狗來(lái)提供關(guān)于狗與當(dāng)時(shí)人們互動(dòng)的線索。
“如果遺體被發(fā)現(xiàn)像殺戮地點(diǎn)一樣有11000歲,那么來(lái)自一只小狗的骨頭將代表北美發(fā)現(xiàn)的最古老的狗文物,”奧斯特蘭德博士說(shuō)。
在接下來(lái)的六個(gè)月中,研究小組應(yīng)該知道他們的嘗試是否可以產(chǎn)生核DNA序列,或者至少是樣品中的線粒體DNA序列。核DNA被包裝到細(xì)胞核內(nèi)的染色體中,并從父母雙方遺傳。線粒體DNA通過(guò)母體向下傳遞,代表人類(lèi)基因組中估計(jì)的20,000至25,000個(gè)基因的一部分。
“核DNA的重要性不容小覷,”奧斯特蘭德博士說(shuō)。“它可以提供有關(guān)狗祖先的信息,當(dāng)代狗和狼之間的相似性,以及狗馴化的時(shí)間,”奧斯特蘭德博士說(shuō)。
Ostrander博士的研究重點(diǎn)是研究生長(zhǎng)調(diào)節(jié)中重要的基因,特別是它們對(duì)影響犬科動(dòng)物和人類(lèi)的疾病的影響。她的研究小組在基因組中搜索控制家犬形態(tài)身體計(jì)劃的基因,家犬的品種表現(xiàn)出非同尋常的變異。他們的大部分研究都集中在使用犬基因組來(lái)理解和鑒定犬科動(dòng)物和人類(lèi)健康的基因。
“NHGRI和史密森學(xué)會(huì)之間的這種高影響力合作代表了合作研究如何看待的一個(gè)典型例子,”NHCES在政策,傳播和教育部門(mén)的NHGRI教育和社區(qū)參與分部主任Vence Bonham說(shuō)。
根據(jù)奧斯特蘭德博士的說(shuō)法,她和她的團(tuán)隊(duì)“非常興奮地等待”這可能是一個(gè)有新聞價(jià)值的發(fā)現(xiàn)。她說(shuō),這項(xiàng)研究的未來(lái)發(fā)現(xiàn)可能會(huì)發(fā)表在學(xué)術(shù)期刊上。
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