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        Axolotl基因組測序

        一個(gè)國際研究小組成功地對墨西哥蠑螈(Ambystoma mexicanum)的基因組進(jìn)行了測序,組裝和分析,這是一種神秘的蠑螈類生物,具有非凡的再生能力。

        Axolotl基因組測序

        Axolotls僅在墨西哥中部,墨西哥城的南部邊緣,在霍奇米爾科附近的運(yùn)河和濕地中聞名。它們并非在它們的范圍內(nèi)均勻分布,而是聚集在特定的地方。

        它們的平均長度為9英寸(20厘米),但長度可達(dá)18英寸(45厘米)。

        Axolotls是新生的水生蠑螈,意味著它們在成年,繁殖狀態(tài)下保留了某些幼蟲特征。它們具有從頭部后面延伸到通氣孔的尾鰭,并且永遠(yuǎn)不會丟失它們的鰓,使它們永久保持在水下。

        動物也是獨(dú)特的,因?yàn)樗鼈兛梢栽偕闹ú荒敲粗匾拇竽X部分。

        “為了充分了解再生并找出其在大多數(shù)物種中如此有限的原因,科學(xué)家們需要獲得基因組數(shù)據(jù)來研究基因調(diào)控和進(jìn)化,”奧地利維也納分子病理學(xué)研究所的Sergej Nowoshilow博士解釋說。和共同作者。

        “到目前為止,由于其龐大的規(guī)模,蠑螈基因組已經(jīng)避免了完整的裝配 - 在320億堿基對,它比人類基因組大10倍以上。”

        “使用現(xiàn)有工具的序列組裝過程被這個(gè)基因組中大量重復(fù)序列所困擾。”

        Nowoshilow博士及其同事是第一個(gè)對蠑螈基因組進(jìn)行測序和分析的研究,蠑螈基因組是有史以來最大的基因組。

        作者解釋說:“使用PacBio平臺,一種產(chǎn)生長讀數(shù)以跨越大型重復(fù)區(qū)域的測序技術(shù),總共72.435.954個(gè)讀數(shù)被測序。”

        “對基因組的分析揭示了幾個(gè)似乎指向動物獨(dú)特性的特征,”他們說。

        “我們發(fā)現(xiàn)僅存在于蠑螈和其他兩棲動物物種中的幾種基因在再生肢體組織中表達(dá)。”

        “最引人注目的是,一種名為PAX3的基本發(fā)育基因在基因組中完全缺失,其功能已被另一種稱為PAX7的基因所接管。”

        “這兩種基因在肌肉和神經(jīng)發(fā)育中起著關(guān)鍵作用。”

        Nowoshilow博士補(bǔ)充說:“我們現(xiàn)在掌握了地圖,以研究腿部等復(fù)雜結(jié)構(gòu)的重建方式。”

        “這是使用axolotl的科學(xué)家群體的轉(zhuǎn)折點(diǎn),這是150多年前開始的一項(xiàng)研究冒險(xiǎn)的真正里程碑。”

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