科學(xué)家揭示一個(gè)簡單的細(xì)胞有4200萬蛋白質(zhì)分子
官員是一些4200萬蛋白質(zhì)分子在一個(gè)簡單的細(xì)胞,顯示領(lǐng)導(dǎo)的研究小組授予布朗,在多倫多大學(xué)的生物化學(xué)教授唐納利細(xì)胞和生物分子研究中心。分析數(shù)據(jù)從幾乎24個(gè)大型研究蛋白質(zhì)豐富的酵母細(xì)胞,第一次團(tuán)隊(duì)能夠產(chǎn)生可靠的估計(jì)為每個(gè)蛋白質(zhì)分子的數(shù)目,顯示在本周在《細(xì)胞》雜志上發(fā)表的一項(xiàng)研究系統(tǒng)。
工作是在與阿納斯塔西亞Baryshnikova合作,做T的U明礬現(xiàn)在棉布首席研究員,加州生物科技公司,專注于老化。
蛋白質(zhì)組成細(xì)胞,做的大部分工作。這樣,他們把生命遺傳密碼,因?yàn)槭匙V為構(gòu)建蛋白質(zhì)是存儲(chǔ)在基因的DNA代碼。
解釋工作,布朗表示,鑒于“細(xì)胞生物學(xué)的功能單位,它只是一個(gè)天生的好奇心,想知道是什么,多少的。”
科學(xué)家的好奇心,但還有另一個(gè)原因要總結(jié)蛋白質(zhì)。許多疾病是由于要么有一定的過多或過少蛋白質(zhì)。更多的科學(xué)家知道如何控制蛋白質(zhì)豐富,越能夠修復(fù)它當(dāng)它出錯(cuò)。
盡管研究人員多年來研究蛋白質(zhì)豐富,研究結(jié)果報(bào)道在任意單位,混亂的種子,使其很難比較不同實(shí)驗(yàn)室之間的數(shù)據(jù)。
許多團(tuán)體,例如估計(jì)蛋白質(zhì)含量堅(jiān)持熒光標(biāo)記蛋白質(zhì)分子和推斷他們的豐富多少細(xì)胞發(fā)光。但不可避免的儀器的差異意味著不同的實(shí)驗(yàn)室記錄不同的細(xì)胞發(fā)出的亮度水平。其他實(shí)驗(yàn)室測量蛋白質(zhì)水平使用完全不同的方法。
“很難概念化有多少蛋白質(zhì)在細(xì)胞中,因?yàn)閿?shù)據(jù)被報(bào)道在截然不同的尺度上,”布蘭登Ho說,研究生在布朗實(shí)驗(yàn)室項(xiàng)目的大部分工作是誰干的。
將任意數(shù)量的措施分子每細(xì)胞Ho轉(zhuǎn)向面包酵母,一個(gè)簡單的單細(xì)胞微生物,研究提供了一個(gè)窗口到一個(gè)基本的細(xì)胞是如何工作的。酵母也唯一的生物,有足夠的數(shù)據(jù)來計(jì)算分子數(shù)量的酵母基因組的6000個(gè)蛋白編碼由于21個(gè)獨(dú)立研究,測量了大量的酵母蛋白質(zhì)。不存在這樣的數(shù)據(jù)集人類細(xì)胞其中每個(gè)細(xì)胞類型只包含20000個(gè)人類基因編碼的蛋白質(zhì)的一個(gè)子集。
現(xiàn)有酵母數(shù)據(jù)意味著Ho的財(cái)富可以把這一切放在一起,基準(zhǔn)和蛋白質(zhì)豐度的模糊的措施轉(zhuǎn)化為“有意義的結(jié)果,換句話說,每個(gè)細(xì)胞分子,”布朗說。
何鴻燊的分析揭示了第一次有多少每一個(gè)蛋白質(zhì)分子在細(xì)胞中,總分子數(shù)約為4200萬左右。大多數(shù)的蛋白質(zhì)存在于一個(gè)狹窄的1000年和10000年之間的分子。一些極其豐富的超過一百萬冊(cè),而其他人則存在于少于10分子細(xì)胞。
分析數(shù)據(jù),研究人員能夠深入了解細(xì)胞的機(jī)制控制大量的不同的蛋白質(zhì),為類似的研究在人類鋪平了道路細(xì)胞這可能有助于揭示分子疾病的根源。他們還表明,蛋白質(zhì)的供應(yīng)與細(xì)胞的作用,這意味著它可能會(huì)使用大量的數(shù)據(jù)來預(yù)測蛋白質(zhì)在做什么。
最后,在這一發(fā)現(xiàn)將為細(xì)胞生物學(xué)家無處不在,何表明縫合發(fā)光標(biāo)記的慣例到蛋白質(zhì)的豐度影響不大。雖然已經(jīng)徹底改變了的方法研究蛋白質(zhì)的生物,其發(fā)現(xiàn)者Osamu Shimomura網(wǎng),Martin Chalfie和錢永健2008年諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng),這也引發(fā)了擔(dān)憂,標(biāo)簽可能會(huì)影響蛋白質(zhì)的耐久性,將缺陷數(shù)據(jù)。
“這項(xiàng)研究將很有價(jià)值的整個(gè)酵母社區(qū),”羅伯特·納什說的高級(jí)biocurator釀酒基因組數(shù)據(jù)庫,將數(shù)據(jù)提供給全世界的研究人員。他還補(bǔ)充說,通過提供蛋白質(zhì)豐度”在一個(gè)通用的和直觀的格式,布朗實(shí)驗(yàn)室為其他研究人員提供了重新審視的機(jī)會(huì)數(shù)據(jù)從而促進(jìn)研究中比較和假設(shè)的一代。”
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