晶體結(jié)構(gòu)揭示了非標(biāo)準(zhǔn)RNA轉(zhuǎn)錄的細(xì)節(jié)
高分辨率晶體結(jié)構(gòu)揭示了在非傳統(tǒng)轉(zhuǎn)錄形式期間RNA的新途徑 - 從DNA模板產(chǎn)生RNA的過程。在重復(fù)轉(zhuǎn)錄過程中捕獲,這是一種轉(zhuǎn)錄形式,其中單個(gè)DNA堿基(由字母A,T,C和G表示)編碼RNA中的幾個(gè)相應(yīng)堿基(DNA中的一個(gè)G導(dǎo)致幾個(gè)Gs)例如,在RNA中,新的晶體結(jié)構(gòu)揭示了通過替代通道離開聚合酶的RNA,以實(shí)現(xiàn)這種非傳統(tǒng)的轉(zhuǎn)錄模式。賓夕法尼亞州立大學(xué)和阿拉巴馬大學(xué)伯明翰分校的一組研究人員發(fā)表的一篇論文發(fā)表在“美國國家科學(xué)院院刊”上。
“在X射線晶體學(xué)的經(jīng)典觀點(diǎn)中,你會(huì)認(rèn)為酶-RNA聚合酶將被滅活,我們無法在結(jié)晶狀態(tài)下捕獲生化過程,”生物化學(xué)教授Katsuhiko S. Murakami說。和賓夕法尼亞州的分子生物學(xué)和該論文的作者。“但在包括我們在內(nèi)的一些系統(tǒng)中,RNA聚合酶仍然存在,因此我們可以在制造RNA的過程中監(jiān)測結(jié)構(gòu)。”
20世紀(jì)60年代早期,賓夕法尼亞大學(xué)的校友和諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)獲得者Paul Berg,斯坦福大學(xué)的Robert W.和Vivian K. Cahill教授,名譽(yù)教授在斯坦福大學(xué)發(fā)現(xiàn)了Reiterative轉(zhuǎn)錄。盡管將DNA序列準(zhǔn)確地轉(zhuǎn)錄成RNA似乎是一個(gè)簡單的錯(cuò)誤 - 當(dāng)RNA鏈相對(duì)于聚合酶內(nèi)部的DNA鏈滑動(dòng)時(shí)發(fā)生重復(fù)轉(zhuǎn)錄 - 它在細(xì)胞中具有功能。重復(fù)轉(zhuǎn)錄在控制許多基因的基因表達(dá)中起著關(guān)鍵作用,但盡管有這一重要作用,其機(jī)制仍然是一個(gè)黑盒子。
“我們的工作擴(kuò)展了我們對(duì)RNA轉(zhuǎn)錄中涉及的分子機(jī)制的靈活性的理解,”賓夕法尼亞州立大學(xué)研究助理兼該論文作者Vadim Molodtsov說。“通過在重復(fù)轉(zhuǎn)錄過程中捕獲RNA聚合酶的晶體結(jié)構(gòu),我們能夠確定RNA用于退出酶的新途徑。它不是通過門進(jìn)入,而是偷偷溜出窗外。”
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