一種新的篩選方法可以檢測直接的生物分子相互作用
蛋白質(zhì)是細(xì)胞的基本組成部分。它們完成大部分工作,對細(xì)胞和身體組織和器官的結(jié)構(gòu),功能和動態(tài)調(diào)節(jié)至關(guān)重要。蛋白質(zhì)很少單獨起作用,它們相互作用,形成蛋白質(zhì)復(fù)合物或結(jié)合DNA和RNA來控制細(xì)胞的作用。這些復(fù)合物是細(xì)胞內(nèi)許多重要反應(yīng)的關(guān)鍵部分,如能量代謝或基因調(diào)控。這些相互作用的任何變化(例如可能由突變引起)都可以使健康和疾病之間產(chǎn)生差異。因此,為了理解細(xì)胞如何運作,或在細(xì)胞中可能出現(xiàn)什么問題,了解它們的構(gòu)建塊如何相互作用是至關(guān)重要的。
新技術(shù)使科學(xué)家在過去幾十年中了解了生物體所具有的遺傳信息,這些信息中的哪些信息被積極使用,哪些蛋白質(zhì)是由細(xì)胞在不同情況下制造的?,F(xiàn)在,了解蛋白質(zhì)和RNA信使分子等生物分子如何結(jié)合形成功能細(xì)胞所需的復(fù)合物是一項巨大的挑戰(zhàn)。換句話說,我們知道細(xì)胞構(gòu)建的成千上萬個部分,但我們不知道它們是如何組合在一起的。
在Nature Communications上發(fā)表的一篇論文中,基因組調(diào)控中心(CRG)的科學(xué)家描述了一種名為“rec-YnH”的新方法的開發(fā),該方法旨在了解數(shù)百種蛋白質(zhì)和RNA之間形成的復(fù)合物。時間。
該方法的開發(fā)由Sebastian Maurer與Luis Serrano實驗室合作開發(fā),是第一種允許同時檢測大量蛋白質(zhì)和RNA分子之間相互作用的技術(shù)。研究人員強調(diào)開發(fā)一種廣泛適用的可行且經(jīng)濟(jì)實惠的方法。
“我們的方法可靠地測量許多蛋白質(zhì)或許多蛋白質(zhì)和RNA片段之間的相互作用,而無需昂貴的專用設(shè)備,”Sebastian Maurer解釋道。“這種方法可以被任何標(biāo)準(zhǔn)的生物醫(yī)學(xué)研究實驗室使用,對于研究細(xì)胞中的特定過程,以及研究人員必須一次探索數(shù)百萬種蛋白質(zhì)相互作用以尋找特定疾病中涉及的復(fù)合物,”他總結(jié)道。
兩個CRG實驗室成功地將他們在生物信息學(xué),生物化學(xué)和分子生物學(xué)方面的專業(yè)知識結(jié)合起來,以實施和驗證該方法。“我們的合作產(chǎn)生了一種經(jīng)濟(jì)實惠且可行的方法,可以生成蛋白質(zhì) - 蛋白質(zhì)和蛋白質(zhì) -RNA相互作用的高質(zhì)量圖譜”,博士后研究員,該論文的共同第一作者Jae-Seong Yang說。
“蛋白質(zhì)和RNA之間的相互作用是許多生物過程的關(guān)鍵,包括基因調(diào)控,我們的方法是第一個能夠同時檢測數(shù)百種蛋白質(zhì)和RNA之間相互作用的方法。擁有如此高效的新工具對于回答與許多疾病有關(guān)的重要問題,“該研究的共同第一作者和CRG研究員Mireia Garriga說。
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