技術為藥物靶向對抗微生物抗性鋪平了道路
新加坡的研究人員開發(fā)了一種新的高通量方法,可以確定核糖核酸(RNA)分子如何以無偏見和大規(guī)模的方式聚集在細胞內。這種新開發(fā)的技術命名為SPLASH,或補骨脂連接和選擇雜交體的測序,用于描述人類和酵母細胞中的RNA網絡,其動力學以及結構組織如何影響細胞中的翻譯和衰變過程。
該項目由A * STAR新加坡基因組研究所(GIS)的萬悅和Niranjan Nagarajan共同領導,并于2016年5月12日在線發(fā)表于Molecular Cell。
RNA是在調節(jié)細胞中基因表達中起重要作用的關鍵分子。雖然科學界已經廣泛研究了過去幾十年中蛋白質和染色質等微型細胞機器如何相互折疊和相互作用,但人們對RNA如何與自身或與其他RNA分子相互作用知之甚少。這種限制促使團隊提出SPLASH以促進對RNA相互作用的理解。
該研究的共同主要作者和GIS干細胞與再生生物學初級首席研究員Wan博士說:“細胞是一臺復雜的機器;我們需要了解其所有組件的配置,以便能夠設計和/或RNA形狀和RNA 相互作用網絡是細胞功能的關鍵。根據細胞需求,這些動態(tài)相互作用網絡可以進行改造。最重要的是,靶向這些網絡可能是抑制傳染性生物的一種手段。Wan博士于2014年獲得了著名的Branco Weiss獎學金,并因其抗菌藥物耐藥性而于2015年獲得青年科學家獎。
該方法將使研究小組能夠研究傳染性生物的轉錄組 - 包括致病細菌,登革熱和寨卡病毒 - 以了解這些基因組中RNA形態(tài)和網絡如何通過病原體感染人類細胞。希望這些理解微生物致病性的努力將有助于新的抗微生物劑,抗病毒劑或針對這些病原體的疫苗。
“能夠首次全面了解RNA相互作用組并捕捉其動力學,這是令人興奮的。我們現(xiàn)在擁有了解RNA結構組織如何影響疾病和病原體生物學的工具,最終的目標是利用這種理解新藥和這篇論文的共同主要作者,GIS計算與系統(tǒng)生物學首席研究員Nagarajan博士補充說,“抗菌藥物”。
地理信息系統(tǒng)執(zhí)行主任Ng Huck Hui教授說:“理解RNA相互作用網絡和基因調控是科學界關注的一個領域。在SPLASH發(fā)展之前,很少有工具可以讓研究人員深入研究這一研究領域?,F(xiàn)在,我們開始了解不同生物體內RNA相互作用網絡的動態(tài)。我希望它能幫助社區(qū)更好地了解RNA在體內如何發(fā)揮作用,從而從他們新獲得的見解中獲益。“
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