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        ScarTrace有助于了解多細(xì)胞生物如何從胚胎祖細(xì)胞中發(fā)育

        研究人員開發(fā)了一種使用單細(xì)胞測(cè)序進(jìn)行全生物克隆追蹤的新方法。在他們發(fā)表在Nature雜志上的論文中,該小組描述了他們?nèi)绾问褂盟麄兊男路椒▽?duì)條形碼斑馬魚細(xì)胞進(jìn)行研究。

        ScarTrace有助于了解多細(xì)胞生物如何從胚胎祖細(xì)胞中發(fā)育

        正如研究人員指出的那樣,胚胎發(fā)育是人類等高度復(fù)雜生物的重要階段 - 只有非常有限數(shù)量的胚胎祖先能夠以某種方式產(chǎn)生所有在成體體內(nèi)結(jié)束的細(xì)胞。為了理解這個(gè)過(guò)程是如何工作的,研究人員進(jìn)一步指出,需要一些方法來(lái)測(cè)量發(fā)生的克隆歷史,同時(shí)以單細(xì)胞分辨率進(jìn)行細(xì)胞識(shí)別。在這項(xiàng)新的努力中,研究人員開發(fā)了一種名為ScarTrace的技術(shù)。該名稱來(lái)自該技術(shù)的一部分,該技術(shù)涉及添加熒光蛋白轉(zhuǎn)基因的串聯(lián)拷貝,這使得可以鑒定由CRISPR-Cas9基因編輯引起的轉(zhuǎn)錄中留下的“瘢痕”。

        利用該技術(shù),研究人員能夠追蹤編碼斑馬魚細(xì)胞的克隆根和細(xì)胞結(jié)果。更具體地說(shuō),他們能夠追蹤成人細(xì)胞從幾個(gè)部位,如腎臟,眼睛和鰭到特定的祖細(xì)胞。他們注意到該技術(shù)足夠靈敏,可以研究祖先承諾產(chǎn)生左眼或右眼時(shí)發(fā)生的過(guò)程。他們還發(fā)現(xiàn),細(xì)胞在皮膚和尾鰭來(lái)自同一祖先出現(xiàn)。他們報(bào)告了魚鰭中免疫細(xì)胞的鑒定,其中克隆來(lái)源于其他種類的血細(xì)胞。

        研究人員提出像他們這樣的方法將有助于追蹤從單個(gè)細(xì)胞到完全發(fā)育的身體的所有事件的最終目標(biāo)。支持這一說(shuō)法的是來(lái)自中國(guó),英國(guó)和美國(guó)的另一個(gè)團(tuán)隊(duì)的工作 - 他們?cè)谕粋€(gè)自然問(wèn)題上發(fā)表了一篇論文,用他們開發(fā)的稱為MAP-seq的單細(xì)胞測(cè)序方法詳細(xì)描述了他們自己的工作。

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