葉綠體基因組序列苦甜

關(guān)于質(zhì)體組織和進化的信息對于改良作物植物和解決光合生物的系統(tǒng)發(fā)育至關(guān)重要。最近赫爾辛基大學(xué)芬蘭自然歷史博物館的研究人員對一種名為苦甜(Solanum dulcamara)的雜草的質(zhì)體基因組進行了測序。

第一個完整的plastome核苷酸序列于1986年發(fā)表于茄屬植物(茄科)的煙草(Nicotiana tabacum L.)。這個具有重要經(jīng)濟意義的大型多樣植物家族包含著名的作物和觀賞植物，如馬鈴薯，番茄，茄子和矮牽?；āＴ赑LoS ONE發(fā)表的研究中，赫爾辛基大學(xué)芬蘭自然歷史博物館(LUOMUS)的研究人員對苦甜(Solanum dulcamara L.)的質(zhì)體基因組進行了測序，為葉綠體工程提供基因組資源。它是一種在芬蘭也常見的二倍體雜草，對由水霉菌(卵菌)致病疫霉引起的最重要的馬鈴薯病晚疫病具有抗性。

研究結(jié)果比最初的想法更重要：

研究PéterPoczai的研究負責(zé)人表示，“當我們試圖將苦甜的plastome與其他茄屬物種進行比較時，我們意識到它無法正常完成，因為基因組注釋似乎包含了很多錯誤。”

該研究首次表明，這些錯誤是由于全世界使用的一種簡單過時的軟件造成的。結(jié)果，這些錯誤被復(fù)制并在遺傳數(shù)據(jù)庫中從一個序列傳播到另一個序列。

“通過努力工作和手工編輯，我們已經(jīng)糾正了所有茄科基因組的這些錯誤，這些基因組將苦樂參半作為茄屬植物葉綠體比較基因組學(xué)的模型。由于大多數(shù)測序項目，一般來說，質(zhì)體基因組學(xué)中注釋錯誤的存在仍然存在。正在使用這個過時的軟件，我們相信它需要被一個已經(jīng)計劃作為我們下一個前沿項目的更先進的工具所取代，“Ali Amiryousefi，Ph.D。LUOMUS的學(xué)生和該研究的第一作者補充說。

提出了一個新的祖先基因組假說

只有經(jīng)過這些改進，LUOMUS小組才能最終對所有的夜間質(zhì)體基因組進行比較分析，他們提出了祖先基因組的假設(shè)。通過這一點，他們能夠證明結(jié)構(gòu)重新安排與這個家庭更大的進化變化相吻合。常見雜草苦甜的質(zhì)體基因組序列將有助于對夜間質(zhì)體基因組注釋進行基準測試，并可作為進一步研究的可靠參考。

“本研究是我們利用LUOMUS的活體溫室和植物標本館收集葉綠體基因組測序和研究開花植物多樣性的研究的一部分。到目前為止，我們已經(jīng)從我們的收集中測序了30個質(zhì)體基因組，現(xiàn)在開始的第一批結(jié)果發(fā)表“總結(jié)Poczai。

鄭重聲明：本文版權(quán)歸原作者所有，轉(zhuǎn)載文章僅為傳播更多信息之目的，如有侵權(quán)行為，請第一時間聯(lián)系我們修改或刪除，多謝。

推薦內(nèi)容