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        研究發(fā)現(xiàn)用于研究的人類細胞系之間存在很大差異

        根據(jù)Nature在2016年進行的一項調(diào)查顯示,超過70%的研究人員未能復(fù)制另一位科學(xué)家的實驗。如果科學(xué)家無法重現(xiàn)彼此的工作,重要的發(fā)現(xiàn)可能永遠不會離開實驗室并對人類健康產(chǎn)生影響。耶魯大學(xué)研究員Yansheng Liu表示,這種“再現(xiàn)性危機”的一個原因可能在于不同實驗室使用的細胞系存在顯著差異。

        研究發(fā)現(xiàn)用于研究的人類細胞系之間存在很大差異

        為了探討這個問題,劉和一個國際科學(xué)家團隊從全球六個國家的十幾個實驗室收集了一個名為HeLa細胞的人類癌細胞系樣本。HeLa成立于20世紀(jì)50年代初,是最古老,最常用的人類細胞系。他們在均勻條件下培養(yǎng)不同的HeLa細胞,并通過使用最先進的蛋白質(zhì)組學(xué)方法和其他大規(guī)模分析觀察基因表達,生長速率,蛋白質(zhì)功能和其他因素隨時間的變化。此外,研究小組設(shè)計了一項實驗來研究細胞系對沙門氏菌感染的反應(yīng)。

        研究小組發(fā)現(xiàn)不同HeLa細胞系之間和內(nèi)部存在顯著差異,尤其是稱為HeLa CCL2和HeLa Kyoto的細胞系。這種變異在基因和蛋白質(zhì)表達以及細胞對感染的反應(yīng)中都很明顯。在一個特定的菌株中,研究人員觀察到早期一代細胞和后三代細胞生長后檢測到的基因表達差異高達7%。

        這些研究結(jié)果強調(diào)了研究人員需要采取措施將這種變異對研究結(jié)果的影響降至最低。例如,他們建議報告研究中使用的特定HeLa細胞系類型。在其他策略中,Liu及其同事還敦促使用早期細胞系,記錄細胞的基本基因組表達,并重復(fù)測試不同樣本或模型或?qū)嶒炇抑械募毎源_保重復(fù)性。

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