土壤中的細菌多樣性受冰河時代的影響
從藥物的角度來看,很少有微生物像鏈霉菌一樣有價值:這一類細菌是目前使用的80%抗生素的來源。一項關于其在北美土壤中分布的新研究表明,多樣性的梯度與緯度相對應,并指向南方和威斯康星州作為獨特的熱點。
研究的資深作者,綜合植物科學學院土壤與作物科學部副教授丹·巴克利說:“你可以在這個星球上的任何地方找到鏈霉菌。” “關于他們最有趣的事情之一就是他們生產(chǎn)了大量的抗生素。目前的想法是他們生產(chǎn)抗生素以保護他們的草坪 - 從字面上和比喻上 - 彼此和其他微生物。”
自從1944年發(fā)現(xiàn)第一種成功的以鏈霉菌為基礎的抗生素治療結(jié)核病以來,利用這一屬的多樣性一直是抗生素發(fā)現(xiàn)的優(yōu)先事項。巴克利和他的研究小組確信,在這些抗生素強國中實現(xiàn)潛力的一個關鍵是更好地了解細菌的進化歷史和生態(tài)。他們分析了來自北美15個地點的樣本,包括草坪,草地和舊田地下的土壤,產(chǎn)生了900多種菌株,代表了鏈霉菌屬家族樹中100多個不同的群體。但正是這種多樣性的模式引起了巴克利和他的團隊的興趣。
“我們看到了強烈的區(qū)域模式,例如某些菌株僅存在于東北或南方,”巴克利說。“南方的多樣性較高,北方較低,與緯度相對應。雖然在植物和動物中觀察到這種模式,但這是首次顯示微生物多樣性緯度梯度的研究之一。”
確定多樣性的一般模式也使得例外非常清楚,包括威斯康星州無漂移區(qū)的高度多樣性,這是該州西南部的一個小區(qū)域。無漂移區(qū)逃離了威斯康星州冰川,該冰川在3萬至1萬年前覆蓋了幾乎所有加拿大和美國北部。
“這是整個研究中最多樣化的樣本,也是整個非洲大陸許多其他地方最多的,”巴克利說。“因此,在未來的工作中,這是一個適合更多采樣的地方。”
多樣性的緯度梯度支持巴克利的假設,即歷史氣候變化,特別是從北到南席卷的重復冰期,是塑造微生物多樣性的關鍵因素。此外,他的研究小組的數(shù)據(jù)顯示,重復范圍擴大和收縮的周期似乎已經(jīng)將塑造細菌多樣性的優(yōu)勢放在運氣和機會上,而不是自然選擇的生存最適合的壓力。
“每次冰川接近時,它都會形成一塊干凈的土壤,因為雖然孢子是耐用的,但它們不能存活數(shù)千年,”巴克利說。“所以你可以想象,對于第一批到達的微生物,它就像是應許之地,沒有競爭,它們可以掃過環(huán)境。”
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