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        基因表達研究揭示了非洲沙門氏菌的新亮點
        
			
        
				2019-01-16 10:20:34
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        利物浦大學(xué)的科學(xué)家們已經(jīng)向前邁出了一步，了解導(dǎo)致沙門氏菌嚴重流行的細菌，目前每年在撒哈拉以南非洲造成大約40萬人死亡。
        

        基因表達研究揭示了非洲沙門氏菌的新亮點
        

        發(fā)表在PLOS Biology期刊上并代表了五年的工作，綜合生物學(xué)研究所的研究人員完成了迄今為止最大的細菌比較基因表達研究之一。
        

        當(dāng)通常引起胃腸疾病的沙門氏菌進入血液并通過人體傳播時，就會發(fā)生侵襲性非傷寒性沙門氏菌病(iNTS)。非洲iNTS流行病是由一種對抗生素有抗藥性的鼠傷寒沙門氏菌(ST313)變異引起的，通常會影響免疫系統(tǒng)被瘧疾或HIV削弱的個體。
        

        研究作者RocíoCanalsAlvarez博士解釋說：“雖然非洲和全球鼠傷寒沙門氏菌的基因組有95%相同，但剩下的5%是非常不同的。” “這些差異大多數(shù)不會引起基因表達的變化，但我們需要確定影響基因表達的基因改變，并可能影響人類細菌感染的結(jié)果。”
        

        為了發(fā)現(xiàn)這些關(guān)鍵的遺傳差異，研究人員在致命的非洲沙門氏菌和導(dǎo)致胃腸炎的常見“全球”版本之間進行了大規(guī)模的比較轉(zhuǎn)錄組學(xué)方法。
        

        研究人員以16種不同的方式培養(yǎng)了每種沙門氏菌菌株，代表了人類感染過程的不同階段。他們還從小鼠巨噬細胞中分離出沙門氏菌 - 細菌在感染期間用來劫持宿主的免疫細胞。
        

        通過在這些不同條件下研究非洲和全球鼠傷寒沙門氏菌的轉(zhuǎn)錄組，他們發(fā)現(xiàn)677個基因和小RNA在兩種菌株之間表達不同。
        

        平行蛋白質(zhì)組學(xué)方法鑒定了導(dǎo)致蛋白質(zhì)水平改變的基因表達差異。兩個原理驗證實驗揭示了非洲沙門氏菌代謝缺陷的遺傳基礎(chǔ)，并發(fā)現(xiàn)了一種新的細菌質(zhì)粒維持系統(tǒng)。
        

        為了讓世界各地的研究人員能夠使用新信息，新數(shù)據(jù)以一個名為SalComD23580基因表達綱要的用戶友好在線工具呈現(xiàn)。
        

        “這項研究將轉(zhuǎn)錄組學(xué)的力量提升到細菌的新水平。我們的'功能轉(zhuǎn)錄組'方法與廣大受眾相關(guān)，可應(yīng)用于許多其他生物。分析管道和社區(qū)數(shù)據(jù)資源方面是通用的，可以激勵他人使用類似的方法來回答他們的研究問題，“領(lǐng)導(dǎo)這項研究的Jay Hinton教授補充道。
        
			

			
          
        
			
        
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