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        用于單細(xì)胞分析的新的快速且穩(wěn)健的方法
        
			
        
				2019-01-13 11:50:03
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        我們身體中的許多細(xì)胞類型以模糊的方式工作，科學(xué)尚未完全理解。這也適用于免疫細(xì)胞，這對于保護(hù)我們免受嚴(yán)重疾病至關(guān)重要。
        

        用于單細(xì)胞分析的新的快速且穩(wěn)健的方法
        

        為了克服這一障礙，研究人員付出了很多努力來尋找研究單個(gè)細(xì)胞內(nèi)部工作的新方法。
        

        “挑戰(zhàn)不僅僅是將單個(gè)細(xì)胞與組織樣本分離。我們還需要找到一種方法來確定個(gè)體細(xì)胞的功能”，生物化學(xué)與分子生物學(xué)系助理教授兼首席研究員Kedar Nath Natarajan說。 ，南丹麥大學(xué)。
        

        在由Wellcome Sanger研究所的Kedar Nath Natarajan和Xi Chen領(lǐng)導(dǎo)的一項(xiàng)新研究中，一個(gè)研究小組開發(fā)了一種新的方法，用于顯微鏡分析器官和組織內(nèi)的微小單細(xì)胞。
        

        這種新方法可以分析來自脾臟的3000多個(gè)細(xì)胞，這是各種免疫細(xì)胞的熱點(diǎn); 細(xì)胞可抵抗感染，但也能提供日常免疫力和反應(yīng)。
        

        不斷開發(fā)新方法以顯微鏡觀察器官和組織內(nèi)的微小單細(xì)胞。原則是研究生物體的基本藍(lán)圖，即DNA以及如何將其包裝在單個(gè)細(xì)胞內(nèi)。這種包裝被稱為染色質(zhì)，并指示藍(lán)圖中哪些基因被打開和關(guān)閉，從而確定它是否變成血細(xì)胞，皮膚細(xì)胞，免疫細(xì)胞，癌細(xì)胞或其他類型的細(xì)胞。
        

        “我們的新方法描述了單個(gè)細(xì)胞內(nèi)的染色質(zhì)，并提供了一種強(qiáng)大，可擴(kuò)展且更便宜的替代現(xiàn)有技術(shù)的方法，這些方法需要昂貴的基礎(chǔ)設(shè)施，專用試劑和設(shè)備，”Kedar Nath Natarajan說。
        

        與Wellcome Sanger研究所的第一作者Xi Chen一起，他領(lǐng)導(dǎo)了新方法的開發(fā)，并介紹了各種細(xì)胞，包括免疫細(xì)胞，干細(xì)胞等.Wellcome Sanger研究所的其他貢獻(xiàn)者是Ricardo J Miragaia，這項(xiàng)工作已經(jīng)完成在通訊作者Sarah A Teichmann的實(shí)驗(yàn)室里。
        

        論文的摘要給出了這樣的描述：
        

        使用測序(ATAC-seq)對轉(zhuǎn)座酶可接近的染色質(zhì)的測定廣泛用于鑒定整個(gè)基因組中的調(diào)節(jié)區(qū)域。然而，由于技術(shù)挑戰(zhàn)，在單細(xì)胞水平(scATAC-seq)進(jìn)行的研究很少。在這里，我們開發(fā)了一種簡單而強(qiáng)大的基于板的scATACseq方法，將前端批量Tn5標(biāo)記與單核分選相結(jié)合。我們證明了我們的方法在各種系統(tǒng)中運(yùn)行穩(wěn)健，包括來自原發(fā)組織的新鮮和冷凍保存的細(xì)胞。通過分析超過3,000個(gè)脾細(xì)胞，我們識(shí)別不同的免疫細(xì)胞類型并揭示細(xì)胞類型特異性調(diào)節(jié)區(qū)域和相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子。
        
			

			
          
        
			
        
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