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        全面的DNA甲基化研究確定了皮膚黑色素瘤的新的進展相關和預后標志物
        
			
        
				2019-01-02 19:24:08
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        隨著越來越多的光照在癌癥的分子領域，遺傳和表觀遺傳變化的結構正在暴露。表觀基因組改變與轉錄后水平的基因表達的修飾相關，而對遺傳密碼本身沒有任何改變。在BMC醫(yī)學中發(fā)表的這種全基因組表觀遺傳學研究中，我們提供了皮膚黑色素瘤發(fā)生和發(fā)展過程中發(fā)生的破壞甲基化模式的全面概述。
        

        

        全基因組甲基化分析
        

        甲基化是一種天然過程，主要發(fā)生在構成DNA的四個“字母”或堿基之一上?；瘜W甲基的修飾通常靶向DNA堿基胞嘧啶。該過程稱為甲基化。這種改變可以打開或關閉基因，從而以完全相同的DNA序列影響腫瘤細胞的轉化和侵襲性。
        

        這些“通斷開關”及其相關甲基化模式的映射可以保持對具有良性與更具侵襲性的腫瘤類型的患者進行分層的預后能力。
        

        我們的研究比較了皮膚黑色素瘤發(fā)展和進展過程中改變的甲基化譜。惡性黑色素瘤的發(fā)展從良性痣開始進入原發(fā)性黑色素瘤，最后是侵襲性轉移，導致繼發(fā)性惡性腫瘤遠離癌癥的初始原發(fā)部位并惡性擴散到全身。
        

        具體而言，我們在這三個不同階段繪制了全球甲基化譜。這使我們能夠深入研究這三個不同階段的多步轉化過程，并證明在腫瘤起始，侵襲性和轉移過程中基因甲基化的重要性。
        

        為了確定這些差異甲基化基因對基因表達的功能意義，我們交叉檢查并匹配公開可用的基因表達數據集及其相關的位點特異性樣品和進展階段。該詢問顯示差異表達基因與其相關甲基化模式之間的反射表達模式，再次表現出基因表達與其甲基化狀態(tài)之間的重疊和顯著性。當功能性地對這些差異甲基化基因進行分類時，鑒定了涉及細胞/組織極性和細胞 - 細胞粘附的某些中樞黑素瘤和轉移相關途徑。
        

        簽名驗證：黑色素瘤生存特征
        

        觀察基因表達特征的最新進展已經導致開發(fā)了預測患者結果被引入市場的測定。這些新型測試越來越多地用于各種癌癥類型，以幫助臨床醫(yī)生選擇最佳的治療方案。類似地，盡管處于表觀基因組水平，我們能夠鑒定與患者存活相關的DNA甲基化標記，即預后相關性。
        

        蛋白質表達的預后價值
        

        最后，我們通過免疫組織化學檢查了蛋白質水平上幾種差異甲基化基因的表達。這提供了關于獨立黑素瘤患者群組的預后信息，因此為臨床效用提供了額外的機會。
        

        這些結果反映了通過差異甲基化模式(“通斷開關”)在輔助從良性痣到原發(fā)性腫瘤病變到轉移性擴散的轉化過程中調節(jié)表觀基因組的重要性。重要的癌癥相關途徑有助于從無害的良性狀態(tài)轉變?yōu)楦吖粜缘谋硇?。通過基于DNA甲基化的生物標記物跟蹤這些變化的能力提供了改善和促進傳統(tǒng)組織病理學參數(例如腫瘤厚度，有絲分裂指數或潰瘍)的分層能力的機會。
        
			

			
          
        
			
        
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