Rostyk Kuzyakiv的9月虛擬研討會(huì)采訪
數(shù)據(jù),如金錢,似乎正在推動(dòng)世界這些日子。在過(guò)去的幾十年里,數(shù)據(jù)生成技術(shù)發(fā)展得如此之快,以至于它已經(jīng)創(chuàng)造 - 并且將繼續(xù)這樣做 - 大量的數(shù)據(jù),像一個(gè)非常大的野生動(dòng)物,需要被馴服和傾向于。大學(xué)的能力中心和核心設(shè)施在過(guò)去20年中已經(jīng)萌芽,作為集中所生成數(shù)據(jù)的一種手段,提供了存儲(chǔ),分析和可視化數(shù)據(jù)的方法。在各種領(lǐng)域:從物理學(xué)和生命科學(xué),到天文學(xué)和經(jīng)濟(jì)學(xué)。Rostyk Kuzyakiv是蘇黎世大學(xué)SIB高性能計(jì)算中心和核心設(shè)施S3IT的數(shù)據(jù)科學(xué)家,并與LarsMalmström博士(S3IT高級(jí)數(shù)據(jù)科學(xué)家)一起負(fù)責(zé)IPortal,
S3IT的冒險(xiǎn)始于2014年,其靈感來(lái)自于另一個(gè)著名的核心設(shè)施:Vital-IT。幾年后出現(xiàn)了IPortal,當(dāng)時(shí)顯然生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)迫切需要自己的設(shè)施。“生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)是 - 現(xiàn)在仍然是 - 正在涌入。我們正在處理許多項(xiàng)目,而且難以應(yīng)對(duì),” Kuzyakiv說(shuō)。“不僅需要一個(gè)專門用于生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)及其分析的地方,而且研究人員可以輕松地參考并回到這個(gè)地方變得必要。”為此,Kuzyakiv,Malmström及其團(tuán)隊(duì)與參與此類數(shù)據(jù)及其理解的研究人員進(jìn)行了交流。 ,掌握數(shù)據(jù)存儲(chǔ)和檢索方面的具體需求,分析軟件和可視化結(jié)果的工具。
“IPortal是一個(gè)超級(jí)友好的四步系統(tǒng),” Kuzyakiv繼續(xù)道。研究人員可以將數(shù)據(jù)復(fù)制并粘貼到系統(tǒng)中。然后要求他們注釋他們的數(shù)據(jù)集。“這是研究人員傾向于回避的部分,” Kuzyakiv感到遺憾。“但這是這個(gè)過(guò)程的重要組成部分; 它為您提供了輕松識(shí)別和檢索您的工作的方法,以用于任何未來(lái)目的。“ Malmström補(bǔ)充說(shuō):” IPortal 的力量源于簡(jiǎn)約的設(shè)計(jì)方法。所有基礎(chǔ)組件都在商業(yè)友好的開(kāi)源許可證下,大多數(shù)組件已經(jīng)存在了十年或更長(zhǎng)時(shí)間,這意味著它們既已建立又穩(wěn)定。“
盡管知識(shí)產(chǎn)權(quán)還處于初期階段,但它已經(jīng)對(duì)許多項(xiàng)目至關(guān)重要,其中最新項(xiàng)目的結(jié)果已于今年6月在EMBO報(bào)告中公布。目前,所有用戶均位于蘇黎世大學(xué)。當(dāng)被問(wèn)及“局外人”能否從IPortal中受益時(shí),Kuzyakiv回答說(shuō)這是他們正在努力的事情,這應(yīng)該發(fā)生在2019-2020期間。
Rostyslav Kuzyakiv目前在蘇黎世大學(xué)的科學(xué)服務(wù)和支持IT(S3IT)部門擔(dān)任數(shù)據(jù)科學(xué)家,該部門是SIB的HPC和核心設(shè)施。
在2003年在烏克蘭獲得醫(yī)學(xué)博士學(xué)位后,他在擔(dān)任多倫多大學(xué)醫(yī)學(xué)博士之前曾在多倫多東部綜合醫(yī)院擔(dān)任臨床項(xiàng)目經(jīng)理?;氐綒W洲后,他成為日內(nèi)瓦SIB的研究員,同時(shí)還擔(dān)任日內(nèi)瓦大學(xué)醫(yī)院的臨床數(shù)據(jù)經(jīng)理。自2014年以來(lái),Kuzyakiv在S3IT監(jiān)督本地和國(guó)際項(xiàng)目,專注于生命科學(xué)和醫(yī)學(xué)的數(shù)據(jù)管理和生物信息學(xué)應(yīng)用。
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