什么是癌癥基因?什么是癌癥基因檢測?
一、什么是癌癥基因?
癌細胞與正常細胞,有很多不同;其中,最重要的不同就是癌細胞中不少基因是變異的:有的基因缺失了,有的基因重復(fù)了,有的基因長歪了……
癌癥中可能發(fā)生許多類型的基因改變。四種主要類型包括:
1) 單核苷酸變異體(SNV),也稱為點突變。SNV由一個堿基處的堿基置換產(chǎn)生。這些可能導(dǎo)致編碼蛋白的氨基酸序列(錯義突變)或蛋白過早截短(無義突變)。
2) 連續(xù)核苷酸的小復(fù)制,涉及一個或幾個核苷酸的插入或缺失,或涉及同時缺失和插入一個或幾個堿基(indelsa)的復(fù)雜突變。這些類型的突變可能是“框內(nèi)的”,導(dǎo)致蛋白質(zhì)中氨基酸的加入或減少,或可導(dǎo)致“移碼”,通常導(dǎo)致蛋白質(zhì)的過早截短。
3) 外顯子或基因拷貝數(shù)目的變化。外顯子拷貝數(shù)變化包括包含整個外顯子并影響蛋白質(zhì)功能結(jié)構(gòu)域的大的重復(fù)或缺失?;?拷貝數(shù)變化包括整個基因的擴增或缺失。
4) 遺傳物質(zhì)的結(jié)構(gòu)變異(SV)或大的結(jié)構(gòu)異常,包括由多個染色體之間或單個染色體內(nèi)的斷點引起的易位或倒位。這些通常導(dǎo)致融合基因和相關(guān)融合蛋白。
通常,致癌突變聚集在來自不同患者的腫瘤的“熱點”突變。一些熱點SNV可能會頻繁發(fā)生,而另一些則很少見。例如,在所有黑素瘤中,40%發(fā)生BRAF V600E 突變,而BRAF L597S 突變的發(fā)生<1%。
二、什么是癌癥基因檢測?
我們都知道,癌癥是一種具有遺傳傾向的疾病,跟基因突變有著千絲萬縷的聯(lián)系,而這些基因在某些程度上,也決定了癌細胞的生長與分裂,并且這種突變也可能會遺傳。這時候就可以針對腫瘤的基因圖譜進行測試,從而確定到底是發(fā)生了哪些突變,而這個過程就叫做基因檢測。
在實際的治療過程中,基因檢測可以幫助醫(yī)生制定最佳的治療方案。比如:一些人患肺癌后,可以利用基因檢測的手段對癌細胞中的EGFR進行檢測,一旦發(fā)現(xiàn)了該突變,就可以利用對應(yīng)的靶向藥進行治療。再比如,有一些非常難以確診的腫瘤,需要依靠特定的基因改變協(xié)助確診。比如,不少肉瘤都長的像梭子一樣,長長扁扁的,這時候如果基因檢測發(fā)現(xiàn)有ASPL-TFE3融合基因,那診斷腺泡軟組織肉瘤,就八九不離十了。
利用各種方法,把這些變異的基因找出來,仔細分析,可以協(xié)助臨床診斷、指導(dǎo)治療選擇、輔助監(jiān)測疾病復(fù)發(fā)和耐藥、預(yù)估生存期等。
腫瘤基因測試范圍從簡單到復(fù)雜。最簡單的測試只檢測一種基因中的一種類型的突變。比如僅在BRAF位置c.1799處尋找特定T到A置換突變的試驗。
相反,最復(fù)雜的測試可以同時檢測所有主要類型的基因改變,包括替換,重復(fù),插入,缺失,插入,基因拷貝數(shù) 變異和結(jié)構(gòu)變體,包括倒位和易位。
三、什么是基于基因檢測的靶向治療?
在惡性腫瘤的治療中,一個令人困惑的問題就是:同一分期、同一病理類型的惡性腫瘤患者,采用相同的治療方案,其療效(如生存期)為什么會存在明顯差異?
隨著人類基因組計劃的完成,研究人員發(fā)現(xiàn)同一類型腫瘤的細胞分子生物學差異可能是導(dǎo)致疾病個體化差異的原因所在,繼而發(fā)現(xiàn)了一些與腫瘤發(fā)生密切相關(guān)的基因,即腫瘤的“驅(qū)動基因”。肺癌已知的驅(qū)動基因包括EGFR、ALK、KRAS、HER2、BRAF、PIK3CA、AKTI、MEKI、NRAS和MET。驅(qū)動基因不同,患者對腫瘤的治療反應(yīng)也就不同,這就是相同分型、分期的腫瘤患者存在療效差異的原因。
目前一些藥物如靶向藥物具有特異性針對某種腫瘤基因突變達到精準殺傷的效果,而不同腫瘤患者腫瘤驅(qū)動基因突變存在差異,因此通過基因檢測,了解患者哪種基因發(fā)生突變,適合應(yīng)用哪種藥物,也就達到了“量體裁衣”的效果,做到了“精準醫(yī)療”。
比如,晚期肺腺癌病友,超過一半都攜帶EGFR、ALK、ROS-1等基因突變,這類病人就有機會嘗試靶向藥了,有效率高、副作用小、生存期相對較長。甚至有一些患者依靠一代一代的靶向藥聯(lián)合傳統(tǒng)放化療,生存期超過10年、20年的超級幸運案例。
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