一只野生的，純正的澳大利亞沙漠野狗叫桑迪馬利基，在世界上最有趣的基因組競(jìng)賽中名列第一。新南威爾士大學(xué)領(lǐng)導(dǎo)的桑迪DNA解碼的提議是太平洋生物科學(xué)SMRT格蘭特的五個(gè)入圍者之一，提供切割 - 特別迷人的植物或動(dòng)物的完整基因組的邊緣測(cè)序。

公眾確定了獲勝者，兩歲的桑迪獲得了41%的國(guó)際社區(qū)選票，緊隨其后的是一只Temple Pitviper蛇，一只太陽(yáng)能海底船，一只爆炸性的轟炸機(jī)甲蟲(chóng)和一只粉紅色的鴿子。

新南威爾士大學(xué)生物技術(shù)與生物分子科學(xué)學(xué)院的項(xiàng)目負(fù)責(zé)人比爾巴拉德教授說(shuō)：“我們很高興我們讓桑迪的DNA序列獲得了公眾的想象。”

“Sandy真的是科學(xué)的天賦。作為一種罕見(jiàn)的，野生的純野狗，她提供了一個(gè)獨(dú)特的案例研究。純野狗介于野狼和家犬之間，具有一系列非馴化特性。因此對(duì)桑迪的基因組進(jìn)行測(cè)序?qū)椭_定一些基因的氣質(zhì)和行為，這些基因是從野生動(dòng)物到完美寵物過(guò)渡的基礎(chǔ)。

“同樣，通過(guò)開(kāi)發(fā)改進(jìn)的野狗純度測(cè)試，學(xué)習(xí)更多關(guān)于野狗遺傳學(xué)將有助于保護(hù)這些美妙的澳大利亞動(dòng)物，”巴拉德教授說(shuō)。

2014年，桑迪和她的姐姐和兄弟被澳大利亞動(dòng)物愛(ài)好者Barry和Lyn Eggleton在Strzelecki Track附近的澳大利亞沙漠中發(fā)現(xiàn)為三周大的幼崽，他們從此手工飼養(yǎng)過(guò)它們。幼崽接近死亡，無(wú)法找到他們的父母。

該野狗測(cè)序項(xiàng)目將率先試查爾斯達(dá)爾文1868年的理論，馴化過(guò)程可以分為兩個(gè)步驟：無(wú)意識(shí)選擇非故意人為影響的結(jié)果;人工選擇是人類繁殖所需特性的結(jié)果。

“這個(gè)項(xiàng)目將揭示狼和野狗(無(wú)意識(shí)選擇)和野狗和狗(人工選擇)之間的DNA變化，”巴拉德教授說(shuō)。

年度國(guó)際PacBio競(jìng)賽的一個(gè)主要目標(biāo)是提高公眾對(duì)科學(xué)的認(rèn)識(shí)以及基因組研究如何使社會(huì)受益，該競(jìng)賽今年吸引了200多個(gè)參賽者。Sandy的團(tuán)隊(duì)設(shè)立了DancingwithDingoes Facebook頁(yè)面，獲得了世界各地人們的支持，包括動(dòng)物保護(hù)主義者和狼，野狗和狗的粉絲。

“我們還與新南威爾士大學(xué)的工作人員和學(xué)生們進(jìn)行了接觸，將兩只來(lái)自Bargo Dingo Sanctuary的純高山野狗帶到校園里供大家見(jiàn)面，”Ballard教授說(shuō)。

最先進(jìn)的PacBio技術(shù)允許DNA在含有數(shù)萬(wàn)個(gè)堿基的長(zhǎng)切片中進(jìn)行測(cè)序，而不是像現(xiàn)有技術(shù)那樣在幾百個(gè)堿基的較短切片中測(cè)序。這可以揭示基因組中影響基因表達(dá)的重要重排。

測(cè)序?qū)⒃趤喞Ｄ谴髮W(xué)進(jìn)行，并由Computomics在德國(guó)進(jìn)行初步分析。

Sandy項(xiàng)目背后的澳大利亞團(tuán)隊(duì)還包括悉尼大學(xué)的Claire Wade教授，新南威爾士大學(xué)的Richard Melvin博士，葡萄園獸醫(yī)醫(yī)院的Robert Zammit博士和Garvan醫(yī)學(xué)研究所的Andre Minoche博士。

新南威爾士大學(xué)在基因組學(xué)研究方面享有盛譽(yù)，該大學(xué)的Ramaciotti基因組學(xué)中心的科學(xué)家們研究了各種其他重要的本土生物的基因組，包括考拉，塔斯馬尼亞惡魔，袋熊，鴨嘴獸，昆士蘭果蠅。和Wollemi Pine。

新南威爾士大學(xué)分子生物學(xué)家兼副校長(zhǎng)(教育)教授梅林克羅斯利說(shuō)：“我們?yōu)樾履贤柺看髮W(xué)對(duì)基因組學(xué)貢獻(xiàn)的歷史感到非常自豪，我們很高興桑迪的基因組現(xiàn)在將被列為贏得這項(xiàng)競(jìng)賽的獎(jiǎng)項(xiàng)。”

“澳大利亞有許多有趣的動(dòng)物進(jìn)行測(cè)序，結(jié)果增強(qiáng)了我們對(duì)進(jìn)化和生物學(xué)的理解，并有助于改善農(nóng)業(yè)和蟲(chóng)害管理”。

有關(guān)Sandy Maliki及其兄弟姐妹Eggie Warrigal和Didi Mirigung的更多信息，請(qǐng)參閱他們的Pure Dingo Facebook頁(yè)面。

Dingoes大約5000年前被引入澳大利亞。人們普遍認(rèn)為他們沒(méi)有被澳大利亞土著居民馴化。純野狗變得越來(lái)越稀少，因?yàn)楸镜貏?dòng)物與野狗和家犬雜交，并且被土地所有者作為害蟲(chóng)。