暫停閱讀交通標志細菌中DNA轉(zhuǎn)錄的調(diào)節(jié)

細胞的生存 - 除了其他重要方面 - 時間問題：歌德大學(xué)的科學(xué)家和其他大學(xué)的同事現(xiàn)在已經(jīng)確定了這種機制的不同部分，并介紹了該過程的模型。

生物學(xué)的核心原則之一是信息從DNA流向RNA，以編碼在細胞中起作用的蛋白質(zhì)?？梢哉f，與遺傳密碼一樣重要的是這種信息流的時機。通過在合適的時間產(chǎn)生正確的RNA和正確的蛋白質(zhì)，細胞可以有效地制定其生存和成功的策略。一種這樣的調(diào)節(jié)元件，即核糖開關(guān)，作為抗生素的潛在靶標引起了人們的興趣。經(jīng)過10多年的研究，歌德大學(xué)的Harald Schwalbe教授與威斯康星大學(xué)的Landick小組，歌德大學(xué)生物系的JensWöhnert教授和達姆施塔特工業(yè)大學(xué)的Süß小組合作，

核糖開關(guān)是一小段RNA，可以折疊成不同的結(jié)構(gòu)，這取決于一個小的信使分子是否與它結(jié)合。在轉(zhuǎn)錄核糖開關(guān)中，這些不同的結(jié)構(gòu)表明附近的RNA聚合酶繼續(xù)產(chǎn)生RNA或停止。在他們最近在ELife上發(fā)表的文章中，Schwalbe組及其合作者在合成后釋放了xpt-pbuX核糖開關(guān)的分子結(jié)構(gòu)，并在小信使分子鳥嘌呤結(jié)合后的位置上釋放。他們還證明了這種切換到接通位置需要一定的時間。這對該監(jiān)管程序提出了一定的要求。

由于RNA聚合酶沿著DNA鏈飛行，產(chǎn)生相應(yīng)的RNA，它到達xpt-pbuX開關(guān)的代碼，制造核糖開關(guān)，并繼續(xù)。如果不在鳥嘌呤周圍，RNA聚合酶將檢測默認的關(guān)閉位置并停止合成。然而，如果鳥嘌呤與核糖開關(guān)結(jié)合，則核糖開關(guān)需要重新折疊到位置，RNA聚合酶必須等待足夠長的時間才能檢測到新的構(gòu)象。否則，它將始終讀為“關(guān)閉”，并且永遠不會讀取該基因。Schwalbe和他的同事發(fā)現(xiàn)，這種暫停確實存在，并且它被編碼到DNA中。生產(chǎn)xpt-pbuX開關(guān)后，RNA聚合酶在DNA代碼上遇到這個“暫停站點”并減慢速度，讓核糖開關(guān)重新折疊適當?shù)臅r間。

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