計(jì)算工具使用患者的基因組數(shù)據(jù)來(lái)找到膀胱癌的最佳治療方法
我們?cè)谡疹櫥加邪螂装┑幕颊邥r(shí)面臨的挑戰(zhàn)之一是,從一名患者到另一名患者,預(yù)后,階段和對(duì)不同治療方法的反應(yīng)各不相同,”Seth Paul Lerner博士說(shuō)。泌尿外科腫瘤學(xué)和多學(xué)科膀胱癌項(xiàng)目主任以及泌尿?qū)W教授和貝勒醫(yī)學(xué)院泌尿腫瘤學(xué)教授Beth和Dave Swalm。“在為每位患者選擇最佳治療方案時(shí),多樣化的癌癥特征會(huì)帶來(lái)挑戰(zhàn)。”
在貝勒,勒納和他的同事一直在研究肌肉浸潤(rùn)性膀胱癌患者之間這些差異的基因組學(xué)基礎(chǔ)。作為癌癥基因組圖譜研究網(wǎng)絡(luò)小組的一部分,他們?cè)?017年報(bào)告了412種肌肉浸潤(rùn)性膀胱癌的綜合分子特征,結(jié)果確定了五種基于表達(dá)的癌癥亞型。研究人員還報(bào)告了每種亞型的不同生存結(jié)果。例如,一種名為“神經(jīng)元”的亞型具有非常獨(dú)特的表達(dá)譜,并且與較差的存活率和較不利的結(jié)果相關(guān)。
“我們能夠證明突變特征,分子亞型,新的癌癥相關(guān)分子的負(fù)荷以及已知的臨床和病理因素對(duì)患者的總體存活率有非常明顯的影響,”Lerner說(shuō)。“但是,我們?cè)鯓硬拍軐⑦@些知識(shí)運(yùn)用到臨床實(shí)踐中?”
“在2019年發(fā)表于歐洲泌尿外科的這項(xiàng)研究中,我們報(bào)告了計(jì)算工具的開(kāi)發(fā) - 單一患者分類(lèi)器 - 有效地使醫(yī)生能夠使用該患者的基因組數(shù)據(jù)為個(gè)體患者的癌癥分配膀胱癌亞型,”首先說(shuō)作者Jaegil Kim博士,當(dāng)時(shí)他正在研究這個(gè)項(xiàng)目時(shí)在Broad研究所工作,目前是TESARO的一名高級(jí)首席科學(xué)家,TESARO是一家專(zhuān)注于腫瘤學(xué)的公司。
研究人員還將他們的單一患者分類(lèi)器應(yīng)用于IMvigor 210臨床試驗(yàn)所產(chǎn)生的數(shù)據(jù),這些臨床試驗(yàn)使用atezolizumab(一種免疫治療藥物)治療了近400名局部晚期或轉(zhuǎn)移性膀胱癌患者,并報(bào)告了客觀反應(yīng)和總體生存率。這使研究人員能夠?qū)?duì)特定膀胱癌亞型治療的反應(yīng)聯(lián)系起來(lái)。
“最令人興奮的發(fā)現(xiàn)之一是,我們?cè)?017年發(fā)現(xiàn)的侵襲性神經(jīng)元表達(dá)亞型具有較差的存活率和不太有利的結(jié)果,對(duì)阿司佐珠單抗治療反應(yīng)非常好,患者有更好的結(jié)果,”Kim說(shuō)。
“在我們確定具有神經(jīng)元亞型的11名患者中,所有可評(píng)估為客觀反應(yīng)的患者均對(duì)治療有反應(yīng)(兩次完全反應(yīng),六次部分反應(yīng)),或總體為72%。這轉(zhuǎn)化為非常高的生存概率,這是前所未有的在晚期膀胱癌中,“勒納說(shuō)。“盡管這是一小組患者,但我們的基礎(chǔ)研究可以直接轉(zhuǎn)化為臨床環(huán)境,這使我們能夠確定哪種膀胱癌亞型更有機(jī)會(huì)對(duì)特定治療做出反應(yīng),這是非常令人興奮的。”
雖然前瞻性臨床試驗(yàn)需要進(jìn)一步檢測(cè),但研究人員預(yù)計(jì)醫(yī)生可以將單患者分類(lèi)器應(yīng)用于患者的腫瘤基因組數(shù)據(jù),以確定膀胱癌的亞型,然后選擇特定亞型最常用的治療方法。可能會(huì)回應(yīng)。
“膀胱癌每年導(dǎo)致全球約160,000例死亡,我們?cè)谄浞肿訑?shù)據(jù)和生物學(xué)的臨床應(yīng)用方面落后于其他癌癥領(lǐng)域,”Lerner說(shuō)。“但是,我們可以開(kāi)始了解未來(lái)如何使用這些信息為每位患者提供最佳治療方案。”
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