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        現(xiàn)代生物細(xì)胞是如何獲得其運(yùn)輸系統(tǒng)的

        當(dāng)今植物或動物細(xì)胞的內(nèi)部非常類似于繁忙的城市。就像一個(gè)由交通網(wǎng)絡(luò)相互連接的不同地區(qū)的城市大都市,一個(gè)小區(qū)有一個(gè)獨(dú)特的隔間,通過動態(tài)交通系統(tǒng)相互連接。一組這樣的相互連接的隔室 - 高爾基復(fù)合體 - 對于許多細(xì)胞功能是必不可少的,長期困擾科學(xué)家的一個(gè)問題是:如何在一個(gè)細(xì)胞內(nèi)產(chǎn)生如此復(fù)雜的隔室和交通系統(tǒng)?

        現(xiàn)代生物細(xì)胞是如何獲得其運(yùn)輸系統(tǒng)的

        來自國家生物科學(xué)中心的科學(xué)家通過數(shù)學(xué)方法可以回答這個(gè)問題,探索這種組織如何進(jìn)化。來自NCBS西蒙斯中心的Somya Mani和Mukund Thattai表明,高爾基綜合體及其伴隨的交通系統(tǒng)可以從一個(gè)簡單的模型中自發(fā)地出現(xiàn),而不需要特殊的選擇機(jī)制。

        在細(xì)胞內(nèi),高爾基復(fù)合體是一組隔室,對于加工,包裝和運(yùn)輸?shù)鞍踪|(zhì)和其他分子至關(guān)重要。高爾基體的一個(gè)關(guān)鍵特征是其組織為“成熟鏈”,其具有可變分子組成的不同區(qū)室。這些隔室具有不同的加工和包裝功能,特別是在膠原蛋白等巨大蛋白質(zhì)的合成和運(yùn)輸中。

        “現(xiàn)在,這個(gè)成熟系統(tǒng)為了運(yùn)輸巨大的分子而發(fā)展是非常奇怪的。如果你沒有整個(gè)系統(tǒng)工作,你就不能運(yùn)輸大分子,但如果沒有成熟系統(tǒng)的功能,那么驅(qū)動它的是什么演化?” Mukund Thattai問道。“這是一個(gè)經(jīng)典的雞蛋問題或者你稱之為捕獲22的問題,”他說。

        高爾基復(fù)合體的不同區(qū)室通過稱為囊泡的移動膜結(jié)合室彼此連接并連接到其他細(xì)胞區(qū)域。囊泡不斷萌芽或與隔室融合,形成不同類型分子的細(xì)胞范圍轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)。

        為了研究高爾基復(fù)合體的起源,Mani和Thattai模擬了這個(gè)交通系統(tǒng)。他們建立在廣泛而簡單的規(guī)則基礎(chǔ)上,模擬了從源室出來的囊泡流,并與細(xì)胞內(nèi)的目標(biāo)區(qū)室融合。這些事件由出芽和融合矩陣指定,以創(chuàng)建已經(jīng)陷入平衡狀態(tài)的模擬蜂窩交通網(wǎng)絡(luò)的集合。

        現(xiàn)在,Mani和Thattai做了一些非常規(guī)的事情 - 他們隨意地填充了萌芽和融合矩陣。因此,萌芽和融合事件是隨機(jī)的,沒有特定的目的指導(dǎo)這些事件。

        但隨后,他們得到了驚人的結(jié)果。

        在大約25%的模擬中,研究人員遇到的交通網(wǎng)絡(luò)已經(jīng)形成了與高爾基復(fù)合體非常相似的獨(dú)特模式。這意味著盡管缺乏出芽或融合的選擇機(jī)制,但是細(xì)胞中的囊泡交通網(wǎng)絡(luò)可以純粹偶然地產(chǎn)生隔室的功能性“成熟鏈”。

        換句話說,Mani和Thattai的工作表明高爾基復(fù)合體的進(jìn)化可能是非適應(yīng)性的 - 沒有選擇系統(tǒng)需要推動細(xì)胞發(fā)育高爾基復(fù)合體。

        “我們可以爭辯說高爾基可能是為了其他目的而出現(xiàn)的,這是一個(gè)沒有人能夠弄清楚的目的。但這項(xiàng)工作的實(shí)質(zhì)是,沒有其他目的,”Thattai說有關(guān)于最近在eLife雜志上發(fā)表的一篇文章對此進(jìn)行了描述。“但是一旦細(xì)胞有高爾基體,就好了!它是運(yùn)輸巨大分子的一個(gè)很好的系統(tǒng),因此細(xì)胞使用它,”他繼續(xù)道。

        科學(xué)家們現(xiàn)在正計(jì)劃利用他們的模型來研究結(jié)核病和艾滋病等感染性系統(tǒng),這些系統(tǒng)是由細(xì)胞內(nèi)寄生蟲引起的,這些寄生蟲劫持了細(xì)胞的囊泡交通系統(tǒng)供自己使用。

        “我們模型的參數(shù)可以很容易地根據(jù)交通分子的生物學(xué)特性來解釋。因此,我們的模型可能為我們提供了結(jié)核分枝桿菌等寄生蟲用于劫持囊泡運(yùn)輸系統(tǒng)的分子機(jī)制的線索,”Mani說。“我們還可以研究細(xì)胞在感染后可以用來恢復(fù)其正常交通系統(tǒng)的機(jī)制,”她補(bǔ)充道。

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