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        環(huán)狀DNA蛋白質(zhì)復(fù)雜的爭(zhēng)論
        
			
        
				2018-11-17 12:07:57
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			  來(lái)源：互聯(lián)網(wǎng)
			
        
		
        
				
		
        
			
        萊斯大學(xué)生物物理學(xué)家有一個(gè)新的細(xì)胞力學(xué)理論,戒指真的。何塞Onuchic大米實(shí)驗(yàn)室決定condensin蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)復(fù)雜。工作解決爭(zhēng)議是否復(fù)雜的是一個(gè)戒指,套索兩雙股DNA或分子“桎梏”由兩個(gè)連接環(huán),每個(gè)爭(zhēng)論一個(gè)雙鏈。
        

        環(huán)狀DNA蛋白質(zhì)復(fù)雜的爭(zhēng)論
        

        達(dá)納Krepel大米博士后研究員領(lǐng)導(dǎo)的研究小組使用一套先進(jìn)的分析工具,使電話:這是一個(gè)環(huán)。他們的工作是第一步理解蛋白質(zhì)的活動(dòng)結(jié)構(gòu)的染色體在有絲分裂和細(xì)胞生命周期的所有階段。這將幫助科學(xué)家理解學(xué)習(xí)如何更好的治療遺傳疾病,包括癌癥。
        

        水稻團(tuán)隊(duì)的為期兩年的研究結(jié)果發(fā)表在《美國(guó)國(guó)家科學(xué)院院刊》上。
        

        Condensin做這個(gè)詞表明:它有助于染色體濃縮到細(xì)胞核。最近的研究表明,condensin及其蛋白質(zhì)伙伴cohesin擠出DNA。但直到現(xiàn)在,沒(méi)有人在如何解決condensin蛋白質(zhì)聚集到他們的功能形式。
        

        Krepel開始分析細(xì)菌condensin復(fù)合體由五個(gè)單元組成,包括兩個(gè)染色體結(jié)構(gòu)的維護(hù)(SMC)蛋白質(zhì)一起作為一個(gè)鉸鏈和長(zhǎng)kleisin蛋白質(zhì)組成的戒指。復(fù)合物在人類真核細(xì)胞核——未來(lái)的目標(biāo)分析——類似于更古老的同行。
        

        Krepel拼圖拼湊起來(lái)通過(guò)結(jié)合和比較現(xiàn)有數(shù)據(jù)的原子結(jié)構(gòu)和個(gè)人的基因序列的蛋白質(zhì)?？捎玫慕Y(jié)構(gòu)來(lái)自x射線結(jié)晶學(xué)的蛋白質(zhì)片段,通過(guò)直接耦合分析和序列信息(DCA),樂(lè)此不疲程序Onuchic和他的同事在2011年提出的共同進(jìn)化的蛋白質(zhì)的氨基酸殘基進(jìn)行了比較。
        

        “我們使用DCA來(lái)推斷共同進(jìn)化對(duì)氨基酸,我們有一些蛋白質(zhì)片段實(shí)驗(yàn),“Krepel說(shuō)。“這是一個(gè)很好的起點(diǎn),然后我們不得不把它們放在一起就像一個(gè)謎。我們想要得到一個(gè)完整的結(jié)構(gòu)和解決沖突是否它是一個(gè)單引號(hào)或雙戒指。”
        

        了解蛋白質(zhì)一起發(fā)展是關(guān)鍵。“這是一個(gè)模塊化機(jī)制由許多蛋白質(zhì),“大米博士后研究員和作者米歇爾·迪Pierro說(shuō)。”一個(gè)蛋白質(zhì)更容易結(jié)晶,但很難算出整個(gè)復(fù)雜的結(jié)構(gòu)。這就是為什么它是理想的共同進(jìn)化,它可以讓我們得到的信息結(jié)構(gòu)復(fù)雜,即使我們沒(méi)有。”
        

        “共同進(jìn)化是自然選擇,”瑞安說(shuō),博士后研究員和論文的合著者。“隨著隨機(jī)突變,某些交互需要保存保持功能的復(fù)雜。”
        

        “我們預(yù)計(jì),這兩個(gè)殘基聚在一起比賽,他們會(huì)一起發(fā)展,“Onuchic說(shuō)。“如果這一突變,不良反應(yīng),另一個(gè)補(bǔ)償。Dana問(wèn)我們能得到這個(gè)序列信息與小晶體結(jié)構(gòu)和確定這些巨大的結(jié)構(gòu),結(jié)果我們可以。”
        

        Onuchic集團(tuán)在賴斯理論生物物理學(xué)中心(聯(lián)合體)發(fā)表了一系列論文,對(duì)蛋白質(zhì)折疊的理論擴(kuò)展到更大的基因組。他預(yù)計(jì)持續(xù)工作最終會(huì)揭示condensin的機(jī)制。“這些東西必須凝結(jié)染色體,”他說(shuō)。“人們知道。但是沒(méi)有人知道它們是怎么做到的。”
        

        Onuchic說(shuō)研究表明,柔性鉸鏈可以幫助打開和關(guān)閉,作為一個(gè)大門,允許DNA鏈,也暗示的水稻研究過(guò)程。但不知道每個(gè)分子的位置復(fù)雜,沒(méi)有辦法完全理解它的功能和動(dòng)態(tài)。
        

        “我們知道condensin復(fù)雜,因?yàn)槿绻銊h除它,有絲分裂不會(huì)發(fā)生,”他說(shuō)。“但沒(méi)有人理解機(jī)制?，F(xiàn)在我們有了這個(gè)結(jié)構(gòu),我們有了第一次理解分子細(xì)節(jié)。”
        
			

			
          
        
			
        
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