新的eDNA工具研究可幫助科學(xué)家發(fā)現(xiàn)深海珊瑚
科廷大學(xué)的研究人員開發(fā)了一種有前途的新工具包,可通過分析從科科斯(基林)群島沿海水域提取的環(huán)境DNA(eDNA)來監(jiān)測受威脅的珊瑚生態(tài)系統(tǒng)。
博士 科廷大學(xué)分子與生命科學(xué)學(xué)院珊瑚保護(hù)與研究小組的候選人賈森·亞歷山大先生說,珊瑚礁系統(tǒng)極易受到人類活動(dòng)和環(huán)境壓力的影響,估計(jì)有三分之一的珊瑚礁建立,或者scleractinian,珊瑚,在國際自然保護(hù)聯(lián)盟紅色名錄中被列為高威脅物種。
亞歷山大說:“鞏膜珊瑚不僅通過為許多其他水下物種提供棲息地和寶貴的食物來源,在海洋生態(tài)系統(tǒng)中發(fā)揮重要作用;它們還提供重要的服務(wù),例如保護(hù)沿海土地免受侵蝕。”
“鑒于珊瑚發(fā)揮著非常重要的作用,重要的是,研究人員在分析這些脆弱物種時(shí)必須獲得準(zhǔn)確的生物多樣性和監(jiān)測工具。我們的研究提供了另一種有用的資源,可以追蹤這些脆弱和快速變化的生態(tài)系統(tǒng)中的珊瑚生物多樣性。”
海洋生物學(xué)家通常將使用SCUBA進(jìn)行水下視覺研究來監(jiān)視珊瑚礁,這可能需要大量勞動(dòng)力,并且需要很高的專業(yè)知識(shí)。
為了提供一種更簡便的監(jiān)測珊瑚礁的方法,研究小組探索了eDNA元條形碼在評(píng)估珊瑚生物多樣性方面可能發(fā)揮的作用。
利用科廷大學(xué)痕跡與環(huán)境DNA(TrEnD)實(shí)驗(yàn)室的設(shè)施,研究人員能夠提取,分析和分類從科科斯(基林)群島的90個(gè)經(jīng)過過濾的地表水樣本中獲取的遺傳物質(zhì),這些樣本位于距爪哇約1080公里和2100公里處來自西澳大利亞州海岸。
這是eDNA元條形碼技術(shù)首次用于分析來自印度洋中部太平洋大區(qū)域的珊瑚。
“每個(gè)水樣都經(jīng)過過濾和冷凍,然后運(yùn)輸?shù)界晁?,在那里提取eDNA并進(jìn)行測序。然后,在Pawsey超級(jí)計(jì)算中心使用計(jì)算機(jī)分析了序列數(shù)據(jù),以成功識(shí)別出該海洋環(huán)境中存在的不同物種。”亞歷山大說。
“通過我們的發(fā)現(xiàn),我們能夠?qū)⑺畼又写嬖诘牟煌愋偷纳汉髋c肉眼觀察到的珊瑚進(jìn)行比較,我們發(fā)現(xiàn)eDNA技術(shù)與傳統(tǒng)的調(diào)查技術(shù)高度互補(bǔ)。
“通過成功檢測地表水eDNA樣品中的鞏膜珊瑚,這項(xiàng)研究增加了越來越多的證據(jù)表明eDNA metabarcoding是檢測和研究海洋生物多樣性的有前途的方法。”
完整的研究論文“使用eDNA元條形碼監(jiān)測珊瑚多樣性的多測定方法的開發(fā)”由Coral Reefs發(fā)表。
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