對(duì)于沙門(mén)氏菌檢測(cè) 基因組工具成為關(guān)鍵

隨著食品工業(yè)向高分辨率全基因組測(cè)序轉(zhuǎn)變，世界糧食供應(yīng)將變得更加安全 - 全基因組測(cè)序同時(shí)檢測(cè)特定生物體的完整DNA。這種使測(cè)序無(wú)處不在的舉措將導(dǎo)致始終如一地可靠地檢測(cè)沙門(mén)氏菌。隨著食品工業(yè)向高分辨率全基因組測(cè)序轉(zhuǎn)變，世界糧食供應(yīng)將變得更加安全 - 全基因組測(cè)序同時(shí)檢測(cè)特定生物體的完整DNA。這種使測(cè)序無(wú)處不在的舉措將導(dǎo)致始終如一地可靠地檢測(cè)沙門(mén)氏菌。

由康奈爾大學(xué)和火星全球食品安全中心(GFSC)的研究人員共同撰寫(xiě)的一篇發(fā)表在“微生物學(xué)前沿”雜志上的論文闡明了突破。

“沙門(mén)氏菌是全球公共衛(wèi)生和經(jīng)濟(jì)影響最大的食源性病原體。它是世界各地腹瀉的主要原因之一，”食品安全教授兼康奈爾食品系統(tǒng)研究所教授Martin Wiedmann說(shuō)。“沙門(mén)氏菌可能是輕微的，也可能導(dǎo)致死亡，因?yàn)樗膰?yán)重程度取決于沙門(mén)氏菌的血清型[不同的變異] - 而這正是我們?cè)噲D找到的。”

該論文描述了世界各地的食品工業(yè)應(yīng)如何更頻繁地使用分子方法來(lái)分類(lèi)和表征沙門(mén)氏菌。本文將舊的亞型實(shí)踐 - 一些可追溯到20世紀(jì)30年代的實(shí)踐 - 與較新的全基因組測(cè)序進(jìn)行了比較，這種方法可以分析更廣泛，更完整的基因組區(qū)域。

Wiedmann說(shuō)，通過(guò)這種技術(shù)，科學(xué)家可以更準(zhǔn)確地識(shí)別特定的沙門(mén)氏菌菌株，并確定疾病爆發(fā)的起源和途徑。

例如，7月初美國(guó)食品和藥物管理局和聯(lián)邦疾病控制和預(yù)防中心(CDC)使用這種技術(shù)，因?yàn)樗麄冮_(kāi)始調(diào)查豬耳狗與人類(lèi)之間的可疑沙門(mén)氏菌聯(lián)系 - 由于人員處理對(duì)待。根據(jù)疾病預(yù)防控制中心的數(shù)據(jù)，當(dāng)時(shí)有13個(gè)州有45例沙門(mén)氏菌病例，其中有12人住院治療。

“全基因組測(cè)序正迅速成為沙門(mén)氏菌亞型選擇的首選方法，”該論文的主要作者，火星全球食品安全中心的高級(jí)研究科學(xué)家Silin Tang說(shuō)。“食品經(jīng)常通過(guò)日益復(fù)雜的供應(yīng)鏈接觸消費(fèi)者，創(chuàng)造了許多食品安全可能受到損害的機(jī)會(huì)。最近的案例強(qiáng)調(diào)了加強(qiáng)食品行業(yè)中沙門(mén)氏菌控制措施的必要性，包括使用適當(dāng)?shù)膩喰凸ぞ呖焖贉?zhǔn)確地跟蹤污染源。 “

唐說(shuō)，食品行業(yè)有機(jī)會(huì)創(chuàng)建生物信息學(xué)專(zhuān)業(yè)人才管道 - 利用軟件工具來(lái)理解生物數(shù)據(jù) - 利用全基因組測(cè)序技術(shù)的全部潛力。

此外，Wiedmann說(shuō)，本文將學(xué)術(shù)分析轉(zhuǎn)化為有用的行業(yè)應(yīng)用。“這將有助于工業(yè)實(shí)施更好的方法來(lái)主動(dòng)解決沙門(mén)氏菌的并發(fā)癥和復(fù)雜性，”他說(shuō)。

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