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        合成生物學(xué)提高了微生物工廠的效率

        研究人員開發(fā)了一種合成生物學(xué)系統(tǒng),用于在微生物中構(gòu)建新的代謝途徑和酶,使微生物能夠變成“細(xì)胞工廠”來生產(chǎn)藥物原料。新設(shè)計(jì)的細(xì)節(jié)發(fā)表在Nature Communications上。

        合成生物學(xué)提高了微生物工廠的效率

        該研究由神戶大學(xué)的研究人員進(jìn)行,作為新能源和工業(yè)技術(shù)開發(fā)組織(NEDO)項(xiàng)目的一部分。該特定NEDO項(xiàng)目的目標(biāo)是實(shí)現(xiàn)微生物中目標(biāo)材料的大規(guī)模生產(chǎn)。

        該團(tuán)隊(duì)選擇生物堿生產(chǎn)作為優(yōu)化目標(biāo),因?yàn)樯飰A是制藥生產(chǎn)中的關(guān)鍵中間體。以前,在微生物中已經(jīng)實(shí)現(xiàn)了生物堿衍生的止痛藥的合成,但是中間酶單胺氧化酶(MAO)的低靶特異性已經(jīng)成為有效生產(chǎn)的障礙。

        為了克服這個(gè)問題,研究人員設(shè)計(jì)了一個(gè)軟件程序來識(shí)別可以繞過MAO的新酶。這表明在家蠶中存在一種稱為3,4-二羥基苯乙醛合成酶(DHPAAS)的酶,可用作MAO的替代品。接下來,科學(xué)家們確定了DHPAAS酶活性中涉及的關(guān)鍵氨基酸,并根據(jù)這些信息創(chuàng)建了一種人工形式的DHPAAS,從而改善了關(guān)鍵生物堿THP的產(chǎn)生。

        這組作者說,這些結(jié)果證明了結(jié)合生物技術(shù)和計(jì)算機(jī)科學(xué)方法的能力,使細(xì)胞工廠能夠快速發(fā)展,制造出有價(jià)值的材料。除藥品外,這種方法也可用于生產(chǎn)精細(xì)化學(xué)品,生物化學(xué)品和生物燃料。將新設(shè)計(jì)的代謝途徑和工程酶引入大腸桿菌中。通過該系統(tǒng),他們能夠平衡多巴胺和DHPAA的關(guān)鍵中間體,通過重新設(shè)計(jì)的“智能細(xì)胞”改善生物堿的產(chǎn)生。對超過100種代謝物進(jìn)行質(zhì)譜分析,使團(tuán)隊(duì)能夠識(shí)別瓶頸反應(yīng)和副產(chǎn)物形成副反應(yīng)。該信息被納入以進(jìn)一步改善下游生產(chǎn)。

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