研究人員對七鰓鰻基因組中的關(guān)鍵神經(jīng)元蛋白進行了注釋
七鰓鰻是一種類似鰻魚的原始脊椎動物,是一種用于神經(jīng)生物學(xué)研究的流行生物,因為它具有相對簡單的神經(jīng)系統(tǒng)。研究脊髓損傷(SCI)的人特別感興趣,因為與人類不同,七鰓鰻可以在脊髓損傷后約8周內(nèi)再生神經(jīng)連接并恢復(fù)正常活動。隨著最近完成的七鰓鰻物種(Petromyzon marinus)的第一個參考基因組,這種魚現(xiàn)在準備加速研究神經(jīng)系統(tǒng)如何正常運作并在受傷后恢復(fù)。
在一項新的研究中,由David Schulz博士和Andrew McClellan博士領(lǐng)導(dǎo)的MU神經(jīng)生物學(xué)家團隊通過在基因組中注釋47個離子通道的序列進一步推進了這一進步。研究人員使用生物信息學(xué)工具從可能屬于離子通道家族的七鰓鰻基因組中鑒定序列,然后在神經(jīng)系統(tǒng)組織中進行系統(tǒng)發(fā)育和基因表達分析以確認鑒定。結(jié)果發(fā)表在Marine Genomics期刊上。
“操縱神經(jīng)系統(tǒng)分子方面的第一步是對構(gòu)成神經(jīng)系統(tǒng)的結(jié)構(gòu)有一個基本的了解。通過識別七鰓鰻用于構(gòu)建其離子通道的序列,我們打開了直接針對這些序列的大門測量他們在細胞類型中的表達水平,改變他們的豐度,看看神經(jīng)系統(tǒng)如何反應(yīng),并檢查他們在從脊髓損傷恢復(fù)中的作用,“負責(zé)研究的MU研究生Adam Northcutt說,他是該文章的第一作者。離子通道是細胞膜中的特殊孔,其將帶電原子(稱為離子)移入和移出細??胞。在神經(jīng)細胞中,離子通道基本上有助于電信號的傳輸和處理。鑒于離子通道在神經(jīng)系統(tǒng)功能中的關(guān)鍵作用,作者表示,知道它們的序列將允許對神經(jīng)系統(tǒng)進行更深入的研究。
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