新研究能夠降低基因編輯的出錯(cuò)幾率
最近,韓國(guó)IBS基因組工程中心的研究人員已經(jīng)確定了基于CRISPR靶向腺嘌呤的基因編輯工具(ABE)的錯(cuò)誤率。對(duì)這一工具的錯(cuò)誤率的評(píng)估對(duì)于其在臨床和生物技術(shù)中的應(yīng)用至關(guān)重要。他們的研究結(jié)果發(fā)表在Nature Biotechnology上。
DNA的四個(gè)堿基:腺嘌呤(A)與胸腺嘧啶(T),胞嘧啶(C)與鳥嘌呤(G)結(jié)合,形成32億字母的獨(dú)特組合,這構(gòu)成了我們的遺傳物質(zhì)。一些遺傳性疾病是由一個(gè)字母的突變引起的,對(duì)此,CRISPR能夠通過處理這種單堿基突變起到修復(fù)遺傳疾病的效果。一直以來,IBS團(tuán)隊(duì)對(duì)研究這一工具的特異性感興趣。
由Jin-Soo Kim領(lǐng)導(dǎo)的研究小組研究了人類細(xì)胞中最近開發(fā)的ABE蛋白ABE7.10的錯(cuò)誤率。他們確定了受ABE7.10影響的人類基因組位置,并掃描了超出目標(biāo)的錯(cuò)誤。為此,他們使用了改編版的Digenome-seq技術(shù)。修改后的Digenome-seq可以檢測(cè)整個(gè)人類基因組中平均60個(gè)脫靶錯(cuò)誤。有趣的是,盡管這三種蛋白質(zhì)被設(shè)計(jì)成針對(duì)同一個(gè)位點(diǎn),但它們識(shí)別出不同的脫靶點(diǎn)。
IBS生物學(xué)家還展示了一些策略來抑制脫靶修改的數(shù)量。在guide RNA末尾添加幾個(gè)G減少了脫靶錯(cuò)誤,以及使用不同類型的Cas9。通過預(yù)裝配的核糖核蛋白,而不是通過質(zhì)粒,等等。
該團(tuán)隊(duì)旨在為ABE的發(fā)展做出貢獻(xiàn),以更精確和有效的方式引入所需的單字母變更。 “隨著基礎(chǔ)編輯器的準(zhǔn)確性得到證實(shí),我們預(yù)計(jì)它將在未來的醫(yī)療和農(nóng)業(yè)領(lǐng)域得到廣泛應(yīng)用,”Jin-Soo Kim說。
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