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        一個湖中微生物多樣性的多種方法
        
			
        
				2019-01-26 09:17:41
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        研究人員對一項為期9年的研究中的細菌基因組進行了測序，組裝和分析，該研究追蹤了威斯康星州淡水湖中微生物群落的演變。已提出競爭模型來回答微生物如何進化的基本問題，但仍不清楚哪種進化模型是正確的。對自然種群的時間序列研究表明，單一模型不適用，事實上，同一環(huán)境中的不同微生物以不同的方式進化。
        

        一個湖中微生物多樣性的多種方法
        

        通過對威斯康星州大學科學家和美國能源部聯(lián)合基因組研究所(DOE JGI)，美國能源部辦公室的研究人員領導的威斯康星大學Trout沼澤湖的九年(2005-2013)多次收集DNA進行測序?？茖W用戶設施，能夠重新組裝數(shù)十個淡水微生物的基因組，并跟蹤他們的基因組成隨時間的變化。令人驚訝的是，他們在生活在同一環(huán)境中的不同微生物群體中發(fā)現(xiàn)了不同的進化過程。例如，該團隊發(fā)現(xiàn)一個細菌群體經(jīng)歷全基因組選擇性掃描，這是一個由最突出的微生物進化模型(即生態(tài)型模型)預測的過程，但從未在野外觀察過。在全基因組選擇性掃描期間，一個人口中的一個成員一旦獲得有利特征就會勝過所有其他人，從而清除人口中的遺傳多樣性。相比之下，他們也發(fā)現(xiàn)了其他細菌群體似乎經(jīng)歷了基因特異性掃描，表明這些群體中高比率的遺傳互換保留了它們的多樣性。在基因特異性掃描期間，通過遺傳重組僅將編碼有利性狀的小片DNA與群體的其他成員共享，從而防止單個顯性菌株的接管。該團隊的結果首次表明，在同一環(huán)境中共存的不同人群可能具有顯著不同的遺傳率交換，這些差異允許人口根據(jù)不同的非排他性理論模型進化。這是2011年美國能源部JGI社區(qū)科學計劃批準的項目中的第一個結論，該項目于2016年1月8日在ISME期刊上發(fā)布。該論文引出了微生物進化和群體基因組學領域的領導者的兩個觀點。
        
			

			
          
        
			
        
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