了解細(xì)菌的起源和傳播可以預(yù)防疾病
鼠傷寒沙門氏菌(Salmonella Typhimurium)DT104是一種侵襲性細(xì)菌,特別成問題,因?yàn)樗呀?jīng)產(chǎn)生了對(duì)許多抗菌藥物的抗性并且能夠迅速傳播到世界各地。利用新技術(shù),丹麥技術(shù)大學(xué)國家食品研究所已經(jīng)能夠?qū)⒓?xì)菌追溯到其起源,并在其產(chǎn)生抗藥性時(shí)進(jìn)行研究。該技術(shù)可用于監(jiān)測(cè)新的細(xì)菌菌株,預(yù)防并且至少了解傳染病。
沙門氏菌是導(dǎo)致全球食源性疾病最多的食源性細(xì)菌之一。S. Typhimurium DT104變種是研究最多的變種之一,因?yàn)樗哂泻軓?qiáng)的侵襲性,并且迅速傳播到世界各地。直到最近,人們才知道它何時(shí)起源或者它是如何傳播的。
就像警方在新技術(shù)的幫助下突然解決感冒病例一樣,國家食品研究所的研究人員使用全基因組測(cè)序,發(fā)現(xiàn)DT104起源時(shí)和細(xì)菌對(duì)常見抗菌藥物產(chǎn)生耐藥性。在全基因組測(cè)序中,同時(shí)映射致病微生物的整個(gè)DNA譜。
細(xì)菌的家譜
在該研究中分析了來自人和動(dòng)物的總共315個(gè)樣品。這些樣本是在1969年至2012年間在六大洲的21個(gè)不同國家收集的。通過檢測(cè)DNA中隨時(shí)間發(fā)生的突變,科學(xué)家們構(gòu)建了細(xì)菌的家譜 - 一種所謂的系統(tǒng)發(fā)育樹。
根據(jù)系統(tǒng)發(fā)育樹,研究人員估計(jì)DT104起源于1948年,來自一個(gè)不明來源,并在1972年它產(chǎn)生了對(duì)許多抗菌藥物的抗性。該分析還揭示了細(xì)菌的全球傳播途徑以及它如何在動(dòng)物物種和人類之間傳播。
豬根除的證據(jù)
1996年為了在丹麥豬群中根除DT104,丹麥為感染DT104的牛群推出了一項(xiàng)衛(wèi)生計(jì)劃。該計(jì)劃要求必須移除動(dòng)物,并且必須徹底清潔和消毒建筑物,然后再用不含DT104的豬重新填充。
衛(wèi)生計(jì)劃于2000年停止,因?yàn)闆]有證據(jù)表明它正在運(yùn)作。然而,國家食品研究所的研究表明,豬的DT104在1999年和2000年的患病率急劇下降,從而證實(shí)該計(jì)劃具有巨大的預(yù)期效果。
監(jiān)督和預(yù)防
利用研究結(jié)果,研究人員可以反駁關(guān)于DT104進(jìn)化的幾個(gè)假設(shè)。他們提倡全基因組測(cè)序用于幫助我們更好地了解過去,以便這些知識(shí)可用于解決當(dāng)前抗菌素耐藥性的問題,并且該技術(shù)可用于監(jiān)測(cè)新的細(xì)菌變異以防止新的感染疾病。
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