足夠的干細胞因子Nanog知道何時減速
轉(zhuǎn)錄因子Nanog在胚胎干細胞的自我更新中起著至關重要的作用。以前不清楚它的蛋白質(zhì)豐度是如何在細胞中調(diào)節(jié)的。HelmholtzZentrumMünchen和慕尼黑技術大學的研究人員與蘇黎世聯(lián)邦理工學院的同事合作,現(xiàn)在在Cell Systems上報告說,現(xiàn)有的Nanog越多,其復制就越少。
每個干細胞研究人員都知道蛋白質(zhì)Nanog,因為它可以確保這些全能者繼續(xù)更新。一場有爭議的爭論圍繞著如何調(diào)節(jié)細胞中Nanog蛋白的數(shù)量。“到目前為止,人們常常認為Nanog會激活自身,以保持胚胎干細胞的多能性,”Carsten Marr博士解釋說。他領導著亥姆霍茲中心慕尼黑計算生物學研究所(ICB)的定量單細胞動力學研究小組。與蘇黎世聯(lián)邦理工學院的同事一起,他和他的團隊開發(fā)了一種名為STILT(譜系樹上的隨機推斷)的算法,現(xiàn)在反駁了這一假設。
利用STILT,科學家們從單個細胞中評估了時間分辨蛋白表達數(shù)據(jù)(已于2015年收集),其中Nanog可通過與熒光蛋白融合檢測到。“我們將以這種方式測量的Nanog動力學與三種不同的模型進行了比較。其中一個挑戰(zhàn)是模型的定量比較,另一個是在算法中考慮干細胞分裂,”第一作者賈斯汀博士報道。 Feigelman,作為博士后從亥姆霍茲中心慕尼黑搬到蘇黎世聯(lián)邦理工學院。“結果顯示,Nanog受所謂的負反饋環(huán)調(diào)節(jié),這意味著細胞中存在的Nanog越多,其繁殖就越少。”
從計算機傳送到培養(yǎng)皿
為了檢查這些結果,科學家計算了如果Nanog 蛋白水平人為增加會發(fā)生什么。“我們實際上成功證實了STILT提出的另一項增加Nanog的單細胞實驗的假設,”研究負責人Marr解釋道。
由于他們的研究,科學家們承諾更好地了解干細胞更新,并希望這些知識可能對未來的醫(yī)學應用有用。“我們還將在未來將STILT應用于其他時間分辨的單細胞數(shù)據(jù),這將使我們深入了解潛在的分子基因調(diào)控機制,”Marr解釋說。
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