精制DNA工具跟蹤原生和入侵魚(yú)類
科學(xué)家現(xiàn)在可以使用懸浮在水中的DNA片段來(lái)編目侵入性或本地物種,而不是用網(wǎng)進(jìn)行水上滾動(dòng)調(diào)用以了解哪些魚(yú)存在于特定的水體中??的螤柎髮W(xué),圣母大學(xué)和夏威夷太平洋大學(xué)的研究發(fā)表于7月14日的“生態(tài)學(xué)和進(jìn)化方法”。“我們已經(jīng)改進(jìn)了環(huán)境DNA(eDNA)工具,因此,如果河流或湖泊已經(jīng)威脅,瀕危或入侵物種,我們就可以確定那里物種的遺傳細(xì)節(jié),”資深作者David Lodge,F(xiàn)rancis J.說(shuō)。 DiSalvo康奈爾大學(xué)阿特金森可持續(xù)未來(lái)中心主任,生態(tài)與進(jìn)化生物學(xué)教授。“利用eDNA,科學(xué)家們可以更好地設(shè)計(jì)管理方案,以根除入侵物種,或者拯救和恢復(fù)瀕臨滅絕的物種。”
此外,通過(guò)在水中取樣DNA片段并使用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)技術(shù),科學(xué)家可以像遺傳復(fù)制機(jī)一樣制作數(shù)十億份DNA用于研究,無(wú)需捕獲魚(yú)類即可收集魚(yú)類棲息地?cái)?shù)據(jù)。
研究從流,湖泊或河流的小水樣開(kāi)始。“魚(yú)有數(shù)百萬(wàn)個(gè)細(xì)胞,當(dāng)它們游泳時(shí),它們會(huì)留下一小塊細(xì)胞。因此,我們正在使用這些細(xì)胞的整個(gè)線粒體基因組來(lái)跟蹤魚(yú)類,”康奈爾大學(xué)博士后研究員,共同領(lǐng)導(dǎo)Kristy Deiner說(shuō)。作者在紙上。
生物學(xué)家通常認(rèn)為從水體中提取的魚(yú)類DNA質(zhì)量差,而且退化程度很高。事實(shí)證明,新的研究是第一個(gè)顯示相反的事實(shí)。例如,在溪流中,大量的魚(yú)DNA保持完整。
“我們?cè)絹?lái)越接近法醫(yī)科學(xué)家每天在犯罪現(xiàn)場(chǎng)所做的事情。他們對(duì)任何人是否在犯罪現(xiàn)場(chǎng)不感興趣,他們有興趣知道哪些人在犯罪現(xiàn)場(chǎng),”洛奇說(shuō)。 。
作為一個(gè)例子,洛奇說(shuō),亞洲鯉魚(yú)長(zhǎng)期以來(lái)一直是芝加哥運(yùn)河系統(tǒng)的入侵物種。“我們只能說(shuō)'是的,這里有亞洲鯉魚(yú)',”他說(shuō)。“隨著這項(xiàng)技術(shù)突破,我們?cè)絹?lái)越接近學(xué)習(xí)有多少 - 基于個(gè)體之間的遺傳差異 - 甚至可能來(lái)自它們。然后,研究人員可以評(píng)估情境危險(xiǎn)并問(wèn),'我們可以關(guān)閉這些入侵魚(yú)的來(lái)源?'“
在使用這項(xiàng)技術(shù)時(shí),戴納說(shuō):“例如,如果我們足夠早地捕獲入侵,就有可能根除人口并防止入侵繼續(xù)進(jìn)行。”
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