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        以色列基因治理公司的目標是將數(shù)據減少到規(guī)模
        
			
        
				2018-12-22 10:03:41
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        已經繪制了人類基因組圖譜，但大多數(shù)人的基因組還沒有 - 至少現(xiàn)在還沒有。當映射單個基因組時，世界將面臨一個問題：世界上的計算機系統(tǒng)中沒有足夠的空間來存儲這些數(shù)據。Petray Tikvah的Geneformics公司首席執(zhí)行官Rafael Feitelberg表示，基因組數(shù)據的大小只是“ 基因組學在世界上無處不在的主要抑制因素之一”。經過測序的人類基因組可能是200到300千兆字節(jié)的原始數(shù)據，而分析的基因組可能占用整個TB的磁盤空間。“如果你想創(chuàng)建基因庫，那么數(shù)據的大小就會非常非常嚴重。”
        

        以色列基因治理公司的目標是將數(shù)據減少到規(guī)模
        

        他表示，Geneformics“致力于提供工具和基礎設施，使基因組學數(shù)據通過壓縮獲得，”Feitelberg說。
        

        繪制人類基因組的關鍵不僅僅是知道基因如何相互作用，而是能夠將這種映射應用于個體。例如，通過映射的基因組，個性化醫(yī)療的時代將蓬勃發(fā)展。醫(yī)生將能夠為患者開發(fā)定制藥物，確保藥物專門用于處理問題而不會產生任何副作用。
        

        Geneformics現(xiàn)在是其全球最大基因測序組織之一，位于馬薩諸塞州的測序公司WuXi NextCode和悉尼Garvan醫(yī)學研究所的客戶。
        

        數(shù)據壓縮中的一個問題是當它被解壓縮以再次起作用時會發(fā)生什么。“數(shù)據壓縮應該是以無損和透明的方式真正隱藏它們的東西，”Feitelberg說。“從壓縮和解決方案的角度來看，這意味著我們能夠以高速解壓縮數(shù)據并實際以無損形式將其流回所有這些應用程序。它與原始的，未壓縮的相同文件。”
        

        基于Weizmann計算生物學家Eran Segal的數(shù)據壓縮工作，Geneformics從以色列雷霍沃特的Weizmann科學研究所發(fā)展而來，他于2014年與職業(yè)技術專家和現(xiàn)任Geneformics首席技術官Arik Keshet共同創(chuàng)辦了該公司。
        

        資金來自包括Geneformics董事長Dov Moran在內的投資者，他創(chuàng)造了DiskOnKey，被廣泛稱為第一款USB閃存盤。據Crunchbase稱，莫蘭和兩家私募股權公司已向Geneformics投入了約285萬美元。該公司最近發(fā)布了Geneformics D，這是其首個純粹基于云的產品。
        

        CTO Keshet說，它是如何運作的，是一個商業(yè)秘密。他說：“這是一個年輕的行業(yè)，到目前為止，確實沒有壓縮標準。你在基因組學方面沒有相應的JPEG或MPEG”。“最終，當這個空間成熟時，我們期望形成標準。屆時，我們將擁有技術和[知識產權]以及市場影響力。”
        

        Feitelberg表示，該公司將會說，數(shù)據節(jié)省可能非常重要。“通過壓縮，我們將占用空間減少高達90%。此外，通過在基因組數(shù)據的粒度級別進行智能分層，我們甚至可以更多地增加這些節(jié)省，”他說。
        

        通過與擁有世界上最大的基因組數(shù)據集之一的Garvan研究所的合作，該公司正在走向國際成功。“能夠為他們建立一個基礎設施是一個非常富有成效的合作伙伴關系，因此他們將一如既往地成長，他們將始終以壓縮和有效的方式成長，”Feitelberg說。“我們的觀點是研究人員和生物信息學家不應該因為數(shù)據壓縮而改變他們所做的分析，”他說。
        
			

			
          
        
			
        
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