蘭花Apostasia shenzhenica的基因組測(cè)序
(Phys.org) - 一個(gè)大型國(guó)際研究團(tuán)隊(duì)對(duì)蘭花Apostasia shenzhenica的基因組進(jìn)行了測(cè)序。在他們發(fā)表在Nature雜志上的論文中,該團(tuán)隊(duì)描述了他們使用的方法以及他們?cè)诖诉^(guò)程中學(xué)到的知識(shí)。正如研究人員指出的那樣,蘭花在當(dāng)今世界普遍存在是輕描淡寫的,它們目前構(gòu)成了所有開(kāi)花植物物種的大約10%,并且除了地球上最極端的棲息地外,它們已經(jīng)被殖民化了。由于其強(qiáng)大的遷移和變化能力以適應(yīng)不同的條件,它多年來(lái)引起了科學(xué)家的興趣。在這項(xiàng)新的努力中,研究人員將他們的工作重點(diǎn)放在了中國(guó)東南部發(fā)現(xiàn)的一種蘭花Apostasia shenzhenica上。它主要是綠色的,有黃色的花朵。了解花的基因組構(gòu)成揭示了它進(jìn)化為適應(yīng)新環(huán)境的方式。
研究人員報(bào)告稱,他們使用10x基因組學(xué)支架進(jìn)行短讀和長(zhǎng)讀測(cè)序,以開(kāi)發(fā)植物的基因組序列。他們還報(bào)告說(shuō),他們使用他們的工作結(jié)果將植物與其他蘭花進(jìn)行比較,以分離出與使用轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)不同的部分相同的部分。
研究小組發(fā)現(xiàn),A。shenzhenica提供了強(qiáng)有力的證據(jù)證明它包含在蘭花科中 - 大部分基因組是其他蘭花類型的虛擬拷貝。他們還發(fā)現(xiàn),數(shù)百萬(wàn)年前,它與其他蘭花分開(kāi),接近蘭花第一次存在的時(shí)間點(diǎn)。他們還發(fā)現(xiàn)蘭花經(jīng)歷了一個(gè)主要的滅絕期,之后植物分化并隨后演變成五個(gè)亞科。他們認(rèn)為,在此期間,著名的“嘴唇”等特征得以發(fā)展。
該小組的研究結(jié)果表明,該植物是進(jìn)一步研究的良好候選者,因?yàn)樗赡芴峁┻M(jìn)化線索,例如導(dǎo)致蘭花有花粉癥(花粉塊)和比其他植物更輕的種子的因素。它也可能解釋另一個(gè)眾所周知的特性 - 使用其他植物獲得支持的能力。
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