微生物組成像技術(shù)揭示了腸道細(xì)菌的混合組織
人體腸道微生物組的破壞與幾種疾病相關(guān),包括肥胖和癌癥。然而,關(guān)于人類腸道中近1,000種細(xì)菌物種的空間組織知之甚少,這可能影響物種彼此之間以及與宿主相互作用的方式。在一項(xiàng)新的合作研究中,伍茲霍爾海洋生物實(shí)驗(yàn)室,福賽思研究所和圣路易斯華盛頓大學(xué)的科學(xué)家們?cè)跓o(wú)菌小鼠中建立了一個(gè)簡(jiǎn)化的模擬人體腸道 微生物組,并通過(guò)在該系統(tǒng)開發(fā)的成像技術(shù)揭示了其結(jié)構(gòu)。 MBL。該研究發(fā)表在本周的“美國(guó)國(guó)家科學(xué)院院刊”上。
“我們認(rèn)為我們會(huì)看到細(xì)菌群,其中一些物種聚集在食物顆粒周圍,其他物種聚集在腸道的粘液層中,將細(xì)菌與宿主組織分開,”MBL科學(xué)家杰西卡馬克韋爾奇說(shuō),該研究的第一作者。“相反,我們看到了一個(gè)混合社區(qū),每個(gè)細(xì)胞往往緊挨著不同物種的細(xì)胞。” 粘液層附近和腸道內(nèi)部(管腔)的細(xì)菌群落看起來(lái)相似,消化的食物被肌肉收縮所推動(dòng)。
“這項(xiàng)研究表明,宿主正在混合微生物,防止大量單一細(xì)菌形成,”馬克韋爾奇說(shuō)。“宿主通過(guò)將粘液和上皮細(xì)胞分解到管腔中,并通過(guò)機(jī)械混合腸道內(nèi)容物來(lái)實(shí)現(xiàn)這一點(diǎn)??赡苓@種混合創(chuàng)造了一個(gè)進(jìn)化穩(wěn)定的微生物群落。”
馬薩諸塞州劍橋市Forsyth研究所的高級(jí)研究員Gary Borisy說(shuō):“以前沒有人以這種方式研究過(guò)復(fù)雜的微生物群落。”如果我們真的想了解微生物組的作用,只知道哪些微生物存在是不夠的。我們還必須了解他們正在做什么,他們正在談?wù)撌裁匆约盀槭裁础_@個(gè)問(wèn)題的部分答案是弄清楚誰(shuí)是旁邊誰(shuí)和誰(shuí)在旁邊什么。”
了解微生物組的空間結(jié)構(gòu)是一個(gè)年輕的領(lǐng)域,這些研究人員正在通過(guò)他們的新型成像技術(shù)開拓。他們?cè)谀P湍c道中看到的與他們先前對(duì)人類牙菌斑的研究形成對(duì)比,在那里他們發(fā)現(xiàn)了高度有組織的細(xì)菌物種組合。
“我們并不完全理解為什么微生物組織在口腔和腸道中的組織如此不同,”馬克韋爾奇說(shuō)。“它可能與流速有關(guān)。在口腔中,如果細(xì)菌不粘附于某物 - 無(wú)論是彼此還是宿主 - 它們最終會(huì)在幾秒鐘內(nèi)進(jìn)入胃中。在腸道中,流動(dòng)內(nèi)容發(fā)生在小時(shí)而不是秒的時(shí)間尺度上。“
Mark Welch和合作者目前正在探索許多人類和海洋生態(tài)系統(tǒng)中的微生物組織,包括人類舌頭,墨魚腸,海藻表面和海洋塑料碎片。
他們的成像技術(shù)使研究人員能夠使用稱為組合標(biāo)記和光譜成像 - 熒光原位雜交(CLASI-FISH)的技術(shù)同時(shí)成像和鑒定15種或更多微生物類群。該團(tuán)隊(duì)的模型腸道微生物組包含15 種細(xì)菌,這些細(xì)菌在人體腸道中通常很豐富。
Read more at: https://phys.org/news/2017-10-gut-bacteria-revealed-microbiome-imaging.html#jCp
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