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        Nidoviruses冗余地表達基因并編碼比以前認為的更多的蛋白質
        
			
        
				2018-12-20 09:47:23
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        動脈炎病毒是屬于Nidovirales的單鏈RNA病毒家族，產生的蛋白質和信使RNA比以前報道的更多，這一發(fā)現(xiàn)提供了關于病毒的重要見解，這種病毒有可能在未來進化以感染人類。新研究。以前，僅報告了9種基因組序列，稱為轉錄調控序列(TRS)，用于感染猴子的動脈炎病毒 Simian 出血熱病毒(SHFV)。然而，這項新研究使用了新一代測序技術，發(fā)現(xiàn)96種TRS被這種病毒用于在SHFV感染的腎細胞和獼猴的白細胞中產生亞基因組信使RNA(sg mRNA)，這些猴子主要在亞洲發(fā)現(xiàn)。發(fā)現(xiàn)四種先前鑒定的TRS不是用于基因表達的主要TRS。
        

        Nidoviruses冗余地表達基因并編碼比以前認為的更多的蛋白質
        

        該研究結果發(fā)表在“ 美國國家科學院院刊”上。“這種病毒目前不會感染黑猩猩或人類，但它是最近被列入一系列病毒的病毒之一，這些病毒可能會在未來發(fā)展為感染黑猩猩和/或人類，”Margo A.博士說。布林頓，該論文的通訊作者和佐治亞州立大學的生物學教授。“沒有人能夠理解究竟是什么限制了這種病毒的宿主范圍.SHFV與幾種引起重大農業(yè)疾病并與SARS(嚴重急性呼吸系統(tǒng)綜合癥)病毒有關的病毒屬于同一病毒組。”
        

        SHFV感染對不同物種的猴子有不同的影響。非洲猴的物種感染通常無癥狀，但亞洲獼猴的感染引發(fā)急性致命的出血性疾病，感染后一至兩周內就會發(fā)生死亡。該病毒感染巨噬細胞和樹突細胞，這些白細胞通常是最初宿主防御病毒感染的必要組成部分。
        

        除SHFV外，動脈炎病毒科還包括導致豬病的豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRSV)，以及引起馬疾病的馬動脈炎病毒(EAV)。
        

        Nidoviruses是動脈炎病毒所屬的大型病毒，也包括冠狀病毒，中間病毒和Ronivirus家族。所有的nidoviruses都具有獨特的復制機制，可以從基因組RNA的右側生成sg mRNA，而病毒復制的多蛋白直接從基因組RNA的左側翻譯。
        

        “TRSs調節(jié)基因組RNA中sg mRNAs模板的產生，”Brinton說。“智慧是每個結構基因都有一個主要的TRS。使用新一代測序來獲得對感染細胞中所有sg mRNA的非常深入的分析，我們發(fā)現(xiàn)許多TRS都存在于結構蛋白(最多11個)并且它們都產生了sg mRNA。人們認為之前發(fā)現(xiàn)的少數(shù)額外的TRS只是備份而且除非主要的突變失活，否則不會被使用，但是我們的數(shù)據(jù)顯示它們都是用過的。”
        

        研究人員還在基因組的左手區(qū)域發(fā)現(xiàn)了產生sg mRNA的TRSs，這種方法為病毒擴增其復制蛋白的豐度提供了另一種方法。
        

        此外，他們發(fā)現(xiàn)一些TRSs產生的sg mRNAs的閱讀框架與基因組不同，這意味著產生了以前未知的蛋白質。通過翻譯核糖體將RNA核苷酸序列讀作三聯(lián)體，每個三聯(lián)體將一個氨基酸添加到生長的蛋白質中。三聯(lián)體稱為閱讀框。如果它被移位一個或兩個核苷酸，則這導致替代的閱讀框架并且翻譯不同的氨基酸序列。
        

        “這一發(fā)現(xiàn)表明，這種病毒實際上可以產生比之前認為的更多的蛋白質，”Brinton說。
        

        該研究還發(fā)現(xiàn)了許多僅產生已知病毒蛋白的末端片段的sg mRNA。
        

        “為了測試這些片段的功能，”Brinton說，“我們通過改變每個起始代碼進行翻譯，一次一個地敲除它們在受感染細胞中的產生。當沒有產生其中兩個片段時產生的病毒減少了，這表明這些小蛋白質中的至少一些在功能上是重要的。
        

        “新發(fā)現(xiàn)的病毒蛋白的功能尚不清楚。我們還有很多東西需要學習如何理解這些病毒蛋白如何操縱感染細胞和/或調節(jié)病毒復制。”
        
			

			
          
        
			
        
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