包括MIPT基因組工程實(shí)驗(yàn)室生物信息學(xué)家Vasily Ramensky在內(nèi)的國(guó)際研究團(tuán)隊(duì)根據(jù)其基因組對(duì)6種非洲綠猴進(jìn)行了分類，研究了它們對(duì)猿猴免疫缺陷病毒(SIV)的遺傳適應(yīng)性，并制作了基因表達(dá)圖譜其中一個(gè)物種。該研究的結(jié)果發(fā)表在Nature Genetics的兩篇文章中。

測(cè)序和基因組比較工具的引入標(biāo)志著動(dòng)物系統(tǒng)學(xué)新時(shí)代的開始，使研究人員能夠在建立遺傳相關(guān)性方面獲得更高的準(zhǔn)確性，而這種相關(guān)性并不總是反映在形態(tài)學(xué)上。通過比較遺傳信息，我們現(xiàn)在可以確定遺傳多樣性最低的物種邊界。在這項(xiàng)研究中，研究人員闡明了非洲綠猴(也稱為黑長(zhǎng)尾猴)的種類之間的遺傳關(guān)系。他們確定了來自非洲各地的六種物種，一種來自巴巴多斯，另一種來自加勒比島嶼圣基茨和尼維斯。但是，基因組分析不僅僅是一種改進(jìn)分類法的方法：它可以提供對(duì)物種的進(jìn)化和地理分布以及物種特異性遺傳疾病的見解，

黑長(zhǎng)尾猴是與人類關(guān)系最密切的非人類靈長(zhǎng)類動(dòng)物。它們長(zhǎng)期以來一直是重要的生物醫(yī)學(xué)模型，廣泛用于行為研究，抗病毒感染研究和疫苗開發(fā)。眾所周知，Vervet是SIV的天然宿主，SIV是HIV的近親。盡管它們經(jīng)常被病毒感染，但SIV對(duì)它們沒有任何傷害：它們已經(jīng)進(jìn)化出了與病毒共存并避免免疫系統(tǒng)退化的能力。在這里報(bào)道的兩篇論文之一中，研究人員分析了一組與SIV相互作用的黑長(zhǎng)尾猴基因。

遺傳分析表明，第一次與SIV相遇的情況發(fā)生在大約一百萬年前。隨著時(shí)間的推移，一個(gè)原始宿主物種分化成許多，每個(gè)物種都獲得了自己對(duì)SIV的遺傳適應(yīng)。研究與黑長(zhǎng)尾猴中宿主 - 病原體相互作用有關(guān)的生物學(xué)機(jī)制提供了關(guān)于與免疫缺陷病毒一起生活的數(shù)百萬年的數(shù)據(jù)。

一個(gè)生物體中的所有細(xì)胞攜帶相同的基因組。但是，取決于組織和生物體的年齡，細(xì)胞可以具有不同組的活性或表達(dá)的基因，其負(fù)責(zé)蛋白質(zhì)合成。在MIPT的基因組工程實(shí)驗(yàn)室工作的Vasily Ramensky與他的外國(guó)同事合作，在各種組織中創(chuàng)建了一個(gè)公開的基因表達(dá)圖譜- 包括四個(gè)大腦區(qū)域 - 來自Vervet Research的60只不同年齡的黑長(zhǎng)尾猴(Chlorocebus aethiops sabaeus)殖民地。與人類受試者研究相比，涉及非人類靈長(zhǎng)類動(dòng)物的研究提供更可靠和可重復(fù)的數(shù)據(jù)有以下幾個(gè)原因：生活條件，飲食和其他環(huán)境因素是統(tǒng)一和可控的。另外，組織制備快速且標(biāo)準(zhǔn)化。最后，遺傳多樣性較低，因?yàn)樯钤谌︷B(yǎng)殖民地的所有動(dòng)物都來自一個(gè)小的共同祖先種群。“由于全基因組測(cè)序，我們積累了大量關(guān)于人類和許多密切相關(guān)物種的遺傳物質(zhì)的數(shù)據(jù)，”擁有物理和數(shù)學(xué)博士學(xué)位并專攻分子生物學(xué)的拉曼斯基說。“然而，我們對(duì)基因所起的作用仍然知之甚少。我們創(chuàng)建的圖譜提供了七個(gè)組織的基因表達(dá)數(shù)據(jù)和七個(gè)發(fā)育階段的基因表達(dá)數(shù)據(jù)。對(duì)于統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)家來說，它將作為理解基因作用的工具。在動(dòng)物的生命中。“

動(dòng)物發(fā)育過程中每個(gè)階段的多組織基因表達(dá)數(shù)據(jù)將有助于確定基因功能并了解與該生物體相關(guān)的功能和發(fā)育模式。例如，研究人員已經(jīng)表明，在兩個(gè)大腦區(qū)域(即Brodmann區(qū)域45和尾狀核)中，vervets的年齡與負(fù)責(zé)發(fā)育和變化的基因的表達(dá)之間存在直接關(guān)聯(lián)。這些基因的表達(dá)與年齡相關(guān)的疾病有關(guān)。