生命科學(xué)如何處理它如何處理基因組信息的山脈
基因測序技術(shù)在過去的幾十年中取得了突飛猛進的發(fā)展。但是,隨著基因組學(xué)家和參與研究項目的其他人產(chǎn)生大量的DNA,RNA或蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù),他們很清楚,存儲和分析所有這些信息正在迅速成為一個棘手的問題。
在最近的一篇文章中 紐約時報突出的困難,列舉多家領(lǐng)先的研究播出他們的挫折與測序和數(shù)據(jù)處理技術(shù)之間創(chuàng)新的步伐不一致。“數(shù)據(jù)處理現(xiàn)在已成為瓶頸,”加州大學(xué)圣克魯茲分校生物分子科學(xué)與工程中心主任大衛(wèi)·豪斯勒告訴“ 紐約時報”。“分析基因組比分析基因組需要花費更多。”
實際上,盡管預(yù)計整個人類基因組測序的價格將在未來幾年內(nèi)降至預(yù)期的1000美元大關(guān),但這種成本與存儲和分析基因組數(shù)據(jù)的費用相比相形見絀。
和海量數(shù)據(jù)(其中科學(xué)家覆蓋在其10月份發(fā)行)也可能會導(dǎo)致設(shè)計存儲信息庫聯(lián)邦的模板。據(jù)“ 泰晤士報”報道,僅在過去的一年中,存儲在一個這樣的數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)量增加了兩倍以上,在300萬億個含氮堿基的接縫處膨脹,占據(jù)了近700萬億字節(jié)的計算機內(nèi)存。
太平洋西北國家實驗室的生物學(xué)家Steven Wiley告訴“ 紐約時報”說:“我們擁有這些巨大的數(shù)據(jù),無法連接它們。” “我坐在我們過去一年半一直試圖分析的一堆數(shù)據(jù)前面。”
推薦內(nèi)容
-
科學(xué)會議抨擊令人深感不安的嬰兒基因編輯主張
一位科學(xué)家推翻了香港會議的聲稱,創(chuàng)造了世界上第一批基因編輯的嬰兒,取消了一個新的談話,周四受到組織者的嚴厲批評,他們認為他是不...
-
甲基化增加了信號蛋白Notch的活性和不穩(wěn)定性
通過蛋白質(zhì)Notch傳遞的細胞信號對動物的一系列發(fā)育過程至關(guān)重要。但是,如果監(jiān)管不力,這些信號可能會導(dǎo)致癌癥等疾病。 昨天(3月24日)在
-
狗的馴化可能導(dǎo)致有害的遺傳變化
根據(jù)上周發(fā)表在美國國家科學(xué)院院刊上的一項研究,狗馴化可能導(dǎo)致了有害的遺傳變化。15000多年前灰狼的家養(yǎng)狗涉及人工選擇和近親繁殖,但這
-
作為婆婆該怎么和媳婦相處?
如果您的媳婦表現(xiàn)出下面這些跡象,可能你需要認真的處理你們之間的關(guān)系。1 她幾乎不接你的電話或回復(fù)你的消息;她很少給你打電話或發(fā)信...
-
腸道微生物組調(diào)節(jié)腸道免疫系統(tǒng)
科學(xué)家早就知道,腸道內(nèi)的細菌,也稱為微生物組,可以為宿主提供各種有用的功能,例如在消化過程中分解膳食纖維,制造維生素K和B7。然而,
-
只有10-25%的人類基因組是功能性的
休斯頓大學(xué)教授Dan Graur在發(fā)表于Genome Biology and Evolution期刊上的一篇論文中指出,人類基因組的功能部分可能介于10%和15%之間,
-
使用基因編輯快速馴化地面
在超市的產(chǎn)品部分購物就像漫步在人類最偉大的發(fā)明博物館。完美的金黃甜玉米穗; 不同大小,形狀和顏色的西紅柿; 和辛辣的墨西哥辣椒都是人
-
研究人員解碼了鼠疫細菌和其他細菌的毒素復(fù)合物
細菌已經(jīng)建立了各種感染生物的策略并將它們用作營養(yǎng)物質(zhì)的來源。許多微生物使用毒素通過簡單地刺穿細胞的外殼來分解細胞膜。人類致病菌...
-
微生物暗物質(zhì)主導(dǎo)著地球的環(huán)境
根據(jù)mSystems發(fā)表的一項新研究,未培養(yǎng)的微生物 - 那些其特征從未被描述過,因為它們尚未在實驗室培養(yǎng)中生長 - 可能在地球上幾乎所有的
-
將細胞電梯式機制拼湊成鈉
在普通食鹽中發(fā)現(xiàn)的鈉不斷地在我們的細胞膜上來回運輸以換取質(zhì)子。這可以調(diào)節(jié)鈉水平,細胞體積和內(nèi)部pH值。研究人員現(xiàn)在已經(jīng)能夠展示蛋...